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Base-pair statistics (frequencies and scores together) (view)

predominant_types
Base-pair types shown in bold in the published table (most frequent).
covarying_types
Base-pair types marked * in the published table (involved in a covariation).
sequences
Number of sequences in the group.

870 rows where group_code = "T" and molecule = "23S" sorted by position_1

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Suggested facets: reference_base_pair, CC, DfDel

conformation 9

  • cWW 832
  • No BP 19
  • tHS 5
  • tSH 5
  • tWW 5
  • cWH 1
  • tHS/tSH 1
  • tSS 1
  • tWH 1

strength 5

  • Strong 782
  • Weak 61
  • Significant 11
  • ??? 8
  • No Support 8

tertiary_type 3

  • 3°: base pair 53
  • 3°: pseudoknot 27
  • 3°: base triple 3

molecule 1

  • 23S · 870 ✖

group_code 1

  • T · 870 ✖
molecule helix_number position_1 ▼ position_2 reference_base_pair conformation tertiary_type strength group_code GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap sequences predominant_types covarying_types Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1_C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc
23S 1 1 2902 G:C cWW   Strong T 40.7 0.9 4.9 10.4 4.3 0.6 1.8 0.3   0.6   0.6     0.3 0.6 33.9 327 GC,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 22 22 9 0.41 0.64 0.86 1.5 0.86 0.94 -0.54 -0.28 0.11 0.21
23S 1 2 2901 G:C cWW   Strong T 36.5 2.8 7.7 17.2 2.5   0.6 0.3 0.3 0.3 0.3 0.6 0.9   1.2 1.5 27.2 326 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 25 23 8 0.33 0.76 0.88 1.65 0.88 0.92 -0.7 -0.5 0.08 0.23
23S 1 3 2900 U:A cWW   Strong T 4.0 5.8 45.2 8.0 0.6 7.1   0.3   0.9   3.1     0.6 3.1 21.1 325 GC,CG,UA,AU,UG,CU,UU GC,CG,UA,AU 16 20 13 0.72 0.53 0.8 1.33 0.8 0.9 -0.39 -0.44 0.01 0.24
23S 1 4 2899 U:A cWW   Strong T 3.4 28.6 31.7 7.1 0.6 0.9 1.5   0.3 0.3   6.2 0.3   0.3 0.3 18.4 325 GC,CG,UA,AU,CU GC,CG,UA,AU 30 28 18 0.62 0.78 0.87 1.65 0.87 0.89 -0.41 -0.49 0.02 0.25
23S 1 5 2898 A:U cWW   Strong T 6.1 2.5 2.1 69.9 0.6 0.6 0.3         0.3     0.3 0.6 16.5 326 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 20 15 9 0.51 0.8 0.97 1.76 0.97 0.98 0.18 0.27 0.02 0.26
23S 1 6 2897 A:U cWW   Strong T 7.4 0.3 4.6 68.7 0.3   0.9           0.6 0.6   0.6 15.9 326 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 16 13 11 0.76 0.8 0.96 1.76 0.96 0.97 0.26 0.22 0.02 0.26
23S 1 7 2896 G:C cWW   Strong T 58.1 4.3 2.7 15.2 1.2   0.6 1.5   0.3 0.3   0.6       15.1 329 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 20 16 10 0.56 0.83 0.95 1.78 0.95 0.96 -0.02 -0.04 0.01 0.27
23S 1 8 2895 C:G cWW   Weak T 4.9 21.6 31.6 3.3 0.6 15.5 1.8 0.6   3.0 0.3     0.3   0.6 15.7 329 GC,CG,UA,AU,UG,CA GC,CG,UA,AU 31 29 7 0.23 0.57 0.73 1.3 0.73 0.92 -0.23 -0.26 0.0 0.27
23S 2 15 525 G:U cWW   Strong T 15.9 12.5 2.4 12.4 41.9 2.5 1.5 1.8 4.8 0.7   1.0 0.3   0.3 0.1 1.7 671 GC,CG,UA,AU,GU,UG,AG CG,UA,GU,AC 34 52 18 0.42 0.3 0.6 0.89 0.44 0.89 0.32 0.14 0.02 0.63
23S 2 16 524 C:G cWW   Strong T 20.7 31.4 17.4 15.3 10.1 1.9 0.6 0.1 0.1 0.3 0.3           1.6 672 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 33 53 22 0.51 0.8 0.86 1.66 0.86 0.98 -0.06 -0.17 0.01 0.63
23S 2 17 523 G:C cWW   Strong T 45.0 11.5 9.6 2.2 3.1 0.1   0.1   0.1 0.3 0.6 0.1     0.1 26.9 676 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 17 27 10 0.46 0.83 0.94 1.77 0.94 0.98 -0.39 0.09 0.15 0.47
23S 2 18 522 U:A cWW   Strong T 2.4 44.5 20.0 1.9   2.2 0.3   0.1     0.1 0.1 0.6   0.4 27.3 676 GC,CG,UA,UG GC,CG,UA,AU 25 45 16 0.46 0.86 0.94 1.8 0.94 0.98 -0.34 0.31 0.15 0.47
23S 2 19 521 A:U cWW   Strong T 6.2 10.5 19.5 20.8 12.9 0.1 0.6       0.1     0.3   1.6 27.3 677 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 34 55 18 0.4 0.7 0.79 1.48 0.79 0.96 -0.81 -0.02 0.14 0.47
23S 2 20 520 C:G cWW   Strong T 4.1 22.3 19.8 21.3 1.0 2.2 0.3 0.1   0.4         0.1 0.6 27.5 677 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 38 48 27 0.63 0.9 0.93 1.83 0.93 0.98 -0.74 -0.66 0.01 0.47
23S 2 21 519 A:U cWW   Strong T 8.9 6.4 5.3 35.9 5.2 9.0     0.4     0.3       0.9 27.7 677 GC,CG,UA,AU,GU,UG GC,AU,UG 37 43 25 0.62 0.49 0.74 1.24 0.78 0.98 -0.67 -0.36 0.02 0.47
23S 2 22 518 C:G cWW   Strong T 1.6 40.5 15.7 3.7   9.5 0.1     0.3 0.3   0.1       28.0 676 CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 28 34 11 0.35 0.67 0.86 1.53 0.86 0.99 -0.39 -0.12 0.01 0.47
23S 2 23 517 G:C cWW   Strong T 55.7 0.4 1.5 12.3 1.5   0.3   0.6               27.6 677 GC,AU GC,CG,UA,AU 17 19 11 0.61 0.86 0.97 1.82 0.97 0.99 -0.03 -0.01 0.02 0.47
23S 2 24 516 G:C cWW   Strong T 51.3 0.1 1.5 16.7 1.3 0.4   0.1   0.4             27.9 676 GC,AU GC,CG,UA,AU 15 29 10 0.46 0.89 0.97 1.85 0.97 0.99 -0.14 -0.13 0.02 0.47
23S 2 30 510 G:C cWW 3°: base pair Strong T 49.1 8.0 2.2 5.0 0.6 0.7 5.9   0.4             0.1 27.8 678 GC,CG,UA,AU,AA GC,CG,AA,UU 37 23 12 0.4 0.61 0.88 1.48 0.89 0.91 0.21 -0.49 0.19 0.47
23S 3 31 474 C:G cWW   Strong T 15.0 45.6 17.6 7.4 0.1 0.6 0.9 0.4 0.4 5.6 0.3 0.1 2.4 0.1 0.1 0.4 2.7 678 GC,CG,UA,AU,CA,GA GC,CG,UA,AU 44 33 18 0.47 0.77 0.88 1.65 0.88 0.89 0.16 0.0 0.02 0.63
23S 3 32 473 C:G cWW   Strong T   90.6 1.5 2.3 0.1 0.7 0.1     1.5 0.3 0.1   0.1 0.1 0.1 2.1 681 CG,AU CG,UA,AU 16 16 9 0.56 0.53 0.96 1.5 0.96 0.97 1.47 1.29 0.02 0.64
23S 4 35 445 G:C cWW   Strong T 94.1     1.6   0.3 0.3                 0.3 3.2 681 GC GC,AU,UG 13 12 9 0.72 0.77 0.99 1.76 0.99 0.99 1.58 1.49 0.02 0.63
23S 4 36 444 G:C cWW   Strong T 65.8 25.5 0.6 3.2 0.3   0.1 0.4   0.1 0.1   0.3       3.3 682 GC,CG,AU GC,CG,UA,AU 15 15 9 0.6 0.95 0.98 1.94 0.98 0.99 0.68 0.7 0.02 0.63
23S 4 37 442 C:G cWW   Strong T 1.5 74.7 12.2 2.9   4.3 0.1     0.4       0.1     3.6 680 CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 36 34 20 0.57 0.77 0.95 1.72 0.95 0.99 0.83 0.85 0.03 0.63
23S 4 38 441 A:U cWW   Strong T 6.3 15.0 31.5 41.6 0.4 0.7 0.3     0.3   0.1         3.5 680 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 34 39 31 0.85 0.96 0.98 1.95 0.98 0.99 0.09 0.07 0.03 0.63
23S 4 39 440 G:C cWW   Strong T 7.0 39.4 22.1 14.8   0.6 1.7 2.1   0.3 1.1 0.8 0.4     0.6 9.0 711 GC,CG,UA,AU,AC GC,CG,UA,AU 47 63 37 0.67 0.85 0.92 1.77 0.92 0.92 -0.2 -0.19 0.02 0.62
23S 4 40 439 U:A cWW   Strong T 9.6 18.6 38.1 6.2 0.3 0.7           0.1   0.1     26.0 709 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 38 48 32 0.74 0.96 0.98 1.95 0.98 1.0 -0.59 -0.54 0.01 0.5
23S 4 41 438 C:G cWW   Strong T 16.2 27.8 9.8 18.6 0.1 0.1           0.1         27.1 711 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 42 47 35 0.79 0.99 0.99 1.99 0.99 1.0 -0.77 -0.69 0.02 0.5
23S 4 42 437 A:U cWW   Strong T 27.6 0.4 3.5 40.9 0.3     0.1                 27.1 711 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 29 36 23 0.71 0.99 0.99 1.98 0.99 1.0 -0.3 -0.3 0.02 0.5
23S 4 43 436 G:C cWW   Strong T 32.8 20.6 4.2 6.9 0.6   2.2   0.6 0.1 0.1       0.1 0.4 31.3 714 GC,CG,UA,AU,AA GC,CG,UA,AU 33 39 27 0.75 0.88 0.94 1.82 0.94 0.95 -0.68 -0.68 0.02 0.47
23S 4 44 434 A:U cWW   Strong T 2.7 3.7 4.2 53.9 1.3 0.4 1.3 1.0 2.0 0.4 0.1   0.8 0.6   0.7 26.8 712 GC,CG,UA,AU,AG GC,CG,UA,AU 23 36 12 0.41 0.55 0.88 1.43 0.88 0.91 -0.15 -0.23 0.03 0.5
23S 4 45 433 G:C cWW   Strong T 47.8 0.4 2.5 7.6 1.5 1.4 0.1 1.7     0.1       3.2 5.0 28.4 713 GC,UA,AU,UC,UU GC,CG,UA,AU 22 34 15 0.54 0.44 0.82 1.26 0.82 0.86 -0.3 -0.28 0.04 0.49
23S 4.1 46 179 G:C cWW   Strong T 24.2 16.1 2.9 0.6   0.1 5.3   3.9 0.7     0.7 0.3 0.1 0.7 44.1 714 GC,CG,UA,AA,AG GC,CG,AA,UU 19 40 11 0.37 0.7 0.83 1.53 0.79 0.79 -0.86 -0.65 0.07 0.38
23S 4.1 47 178 C:G cWW   Strong T 0.1 64.3 0.8 0.6 0.7 1.3 0.1                   32.1 711 CG CG,UA,GU 12 7 4 0.42 0.42 0.97 1.39 0.97 1.0 0.15 0.35 0.03 0.46
23S 5 53 117 A:G tHS 3°: base pair Significant T   0.4 1.5 2.1     0.8 0.3 66.2         0.1   0.3 28.1 719 AU,AG UA,AG 12 11 6 0.52 0.28 0.94 1.22 0.06 0.06 0.42 0.29 0.01 0.49
23S 5 54 116 G:C cWW   Strong T 56.1 0.1 0.6 2.9 12.1               0.1       28.0 720 GC,AU,GU GC,CG,UA,AU 12 16 10 0.71 0.23 0.83 1.06 0.83 1.0 0.35 0.01 0.01 0.5
23S 5 55 115 G:C cWW   Strong T 58.1 0.4   12.4 1.0       0.1       0.1       27.7 724 GC,AU GC,CG,AU 13 7 4 0.4 0.91 0.98 1.9 0.98 1.0 0.09 0.06 0.01 0.5
23S 5 56 114 A:U cWW   Strong T 16.6 2.1 2.2 49.9 0.1 0.4 0.3 0.4 0.1             0.1 27.7 725 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 21 25 19 0.83 0.93 0.98 1.91 0.98 0.99 -0.25 -0.26 0.01 0.5
23S 6 57 70 C:G cWW   Strong T 0.3 65.7 4.8 1.5   0.4 0.1     0.1             27.0 726 CG,UA GC,CG,UA,AU 9 6 7 0.93 0.91 0.99 1.9 0.99 1.0 0.21 0.25 0.0 0.51
23S 6 58 69 G:C cWW   Strong T 70.7   1.0 0.5 0.5   0.1 0.5                 26.6 733 GC GC,UA,AU 4 7 3 0.55 0.55 0.98 1.53 0.98 0.99 0.47 0.46 0.0 0.52
23S 6 59 68 U:G cWW   Strong T 4.6 29.7 14.1 1.4   23.4 0.1 0.1                 26.5 735 GC,CG,UA,UG GC,CG,UA,AU 25 21 15 0.65 0.46 0.68 1.14 0.68 1.0 -0.39 -0.22 0.0 0.52
23S 6.1 61 93 C:G cWW 3°: pseudoknot Strong T 23.0 8.3 5.0 9.9 2.0 0.3 0.4 3.1 0.3   0.1   0.7 0.4 0.4 0.8 45.0 734 GC,CG,UA,AU,GU,AC GC,CG,UA,AU 36 33 21 0.61 0.73 0.84 1.57 0.84 0.89 -0.6 -0.87 0.12 0.39
23S 6.1 62 92   cWW 3°: pseudoknot Strong T 3.1 15.2 13.3 1.5 0.3 0.7 10.4   1.2 0.9 0.4 0.3 0.7 0.4   7.9 43.8 738 GC,CG,UA,AA,UU GC,CG,UA,AU 42 27 17 0.49 0.44 0.59 1.02 0.59 0.6 -0.67 -0.83 0.12 0.4
23S 6.1 64 90 A:U cWW 3°: pseudoknot Significant T 7.8 3.0 0.5 13.6 0.1 0.1 23.2 4.6 0.7   0.3 0.3 0.4 0.3   0.5 44.5 740 GC,CG,AU,AA,AC GC,CG,AA,UU 23 25 11 0.46 0.35 0.62 0.97 0.45 0.46 -0.16 -0.86 0.12 0.39
23S 6.1 65 89 U:A cWW 3°: pseudoknot Strong T 10.4 24.5 4.9 9.1 2.8   0.1 0.1 0.4 0.1     1.9 0.3 0.3 0.1 44.9 740 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 26 25 20 0.78 0.8 0.89 1.68 0.89 0.94 -0.75 -0.9 0.11 0.39
23S 6.1 66 88 C:G cWW 3°: pseudoknot Weak T 0.1 49.5 1.5 0.5 0.1 0.8 0.1   0.9 0.1 0.3   0.3 0.3 0.3 0.3 44.8 740 CG GC,CG,UA,AU 15 8 3 0.26 0.38 0.94 1.32 0.94 0.95 -0.29 -0.15 0.12 0.39
23S 6.2 67 74 U:A cWH 3°: pseudoknot Strong T 9.9 1.5 34.7 6.9 6.2 0.8 0.7 0.1 0.1 0.5 0.5 0.4 0.8 0.5 7.3 1.8 27.1 740 GC,UA,AU,GU,UC GC,CG,UA,AU 33 37 15 0.43 0.48 0.73 1.21 0.73 0.82 -0.45 -0.59 0.0 0.52
23S 7 76 110 C:G cWW   Strong T 0.9 52.3 3.5 0.3   8.3 0.3   0.1 2.3 0.7 0.1   0.7 1.3 0.4 28.7 745 CG,UA,UG,CA GC,CG,UA,AU 25 14 8 0.41 0.25 0.8 1.05 0.8 0.92 -0.09 0.01 0.0 0.51
23S 7 77 109 G:C cWW   Strong T 7.1 13.7 37.3 1.9 0.4 0.4 0.1 8.6     0.7 0.3     0.4   29.2 745 GC,CG,UA,AC CG,UA,GU,AC 35 36 28 0.79 0.68 0.85 1.52 0.85 0.86 -0.65 -0.59 0.01 0.51
23S 7 78 108 U:G cWW   Strong T 4.0 11.0 15.4 9.7 1.1 17.6 0.3     0.3 0.3 0.1 0.8 0.3 0.1 0.3 38.7 745 GC,CG,UA,AU,UG GC,AU,UG,CA 43 51 24 0.51 0.32 0.52 0.83 0.66 0.96 -0.77 -0.7 0.08 0.44
23S 7 79 107 C:G cWW   Strong T 6.7 37.7 11.0 2.7   2.8 6.6   0.1     0.1 2.7 0.5 0.7 0.1 28.2 745 GC,CG,UA,AU,UG,AA,GA GC,CG,UA,AU 43 35 25 0.64 0.6 0.81 1.41 0.81 0.85 -0.66 -0.49 0.0 0.51
23S 7 80 106 G:C cWW   Strong T 54.1 0.4 1.1 3.9 0.5 0.3       0.1   0.1 0.3 0.5 9.8 0.9 27.9 745 GC,AU,UC GC,CG,UA,AU 16 15 10 0.65 0.3 0.82 1.12 0.82 0.84 -0.15 0.12 0.0 0.51
23S 7 81 105 G:C cWW   Strong T 48.7 0.7 1.9 3.4 0.4 0.4 0.1 0.9         0.1     0.1 43.3 744 GC,AU GC,CG,UA,AU 23 13 10 0.56 0.73 0.96 1.7 0.96 0.98 -0.06 -0.27 0.1 0.4
23S 7 82 104 U:A tSH   Strong T   0.1 4.3 0.8 35.6 1.2 0.1 0.1 0.1 0.4 6.2   3.6 0.8 2.6 0.3 43.7 745 UA,GU,CC,GA,UC UA,GU,AG,CC 24 27 9 0.35 0.51 0.82 1.33 0.09 0.75 -0.57 -0.66 0.08 0.4
23S 7 85 97 G:C cWW   Strong T 49.5 0.3 1.1 3.6 1.1   0.1 0.1 0.1       0.3     0.3 43.6 746 GC,AU GC,CG,UA,AU 11 14 9 0.72 0.71 0.96 1.68 0.96 0.98 -0.21 -0.23 0.01 0.4
23S 7 86 96 G:C cWW   Strong T 9.2 36.3 4.0 2.7 0.1 3.8 0.3                   43.6 746 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 40 33 29 0.8 0.79 0.93 1.72 0.93 0.99 -0.68 -0.58 0.01 0.4
23S 7 87 95 U:A cWW   Strong T 2.0 10.1 38.3 2.9   0.5 0.3 0.4   0.1 0.3 0.1     0.7 0.1 44.1 746 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 28 31 23 0.78 0.85 0.95 1.81 0.95 0.96 -0.55 -0.6 0.01 0.4
23S 8 121 130 G:C cWW   Strong T 51.1 0.9 0.1 11.2 5.4   0.7 0.8 0.1     0.1         29.4 753 GC,AU,GU GC,CG,UA,AU 18 22 14 0.7 0.63 0.9 1.53 0.9 0.98 -0.06 -0.16 0.01 0.51
23S 8 122 129 G:C cWW   Strong T 52.8 12.1 1.3 3.7 0.3 0.4         0.1       0.1   29.2 754 GC,CG,AU GC,CG,UA,AU 11 11 8 0.73 0.95 0.99 1.94 0.99 1.0 -0.24 -0.23 0.0 0.51
23S 8 123 128 G:C cWW   Strong T 53.8 0.3 0.4 1.7 0.1 0.3   0.1                 43.3 753 GC GC,CG,UA,AU 8 9 8 0.94 0.82 0.99 1.81 0.99 1.0 -0.06 -0.06 0.01 0.41
23S 9 131 148 A:U cWW   Strong T 23.5 0.8 0.5 25.1 1.6       0.1               48.3 758 GC,AU GC,CG,UA,AU 19 20 17 0.87 0.94 0.97 1.9 0.97 1.0 -0.56 -0.56 0.01 0.37
23S 9 132 147 G:C cWW   Strong T 11.6 23.7 1.1 6.7 8.0 0.3             0.1     0.1 48.4 758 GC,CG,AU,GU GC,CG,UA,AU 28 28 21 0.75 0.69 0.83 1.53 0.83 0.99 -0.78 -0.79 0.01 0.38
23S 9 133 146 U:A cWW   Strong T 0.7 26.5 19.0 2.9   0.5     2.1 0.1 0.1   0.3 0.4   0.1 47.4 759 CG,UA,AU,AG GC,CG,UA,AU 31 30 28 0.92 0.86 0.93 1.79 0.93 0.94 -0.73 -0.64 0.0 0.38
23S 9 134 145 G:C cWW   Strong T 7.4 13.3 8.2 18.0 0.1 1.8   0.1 0.1   0.7 1.7     0.1   48.4 760 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 36 37 35 0.96 0.86 0.91 1.77 0.91 0.95 -0.95 -0.94 0.01 0.38
23S 9 135 144 U:A cWW   Strong T 15.2 17.0 9.4 4.0 0.5 1.1 0.4 0.3   0.9   0.7 0.7     0.3 49.9 759 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 30 39 28 0.81 0.86 0.91 1.76 0.91 0.94 -0.93 -0.94 0.01 0.36
23S 9 136 143 G:C cWW   Strong T 12.9 5.9 6.6 11.3 0.7 1.6 1.7 0.3 1.3     0.1   0.1   0.1 57.4 760 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 21 19 16 0.8 0.8 0.86 1.66 0.86 0.91 -0.95 -0.97 0.01 0.31
23S 9 137 142 U:A cWW   Strong T 7.2 8.7 8.3 5.1 0.7 5.1 0.4 0.8 0.3       0.5 2.1   0.5 60.3 760 GC,CG,UA,AU,UG,GG GC,CG,UA,AU 22 25 18 0.77 0.67 0.74 1.4 0.74 0.88 -0.96 -0.93 0.01 0.29
23S 10 150 176 U:A cWW   Strong T 0.4 30.0 35.3 2.2   0.4 0.1     0.3     0.1 0.1     31.0 759 CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 25 30 23 0.84 0.97 0.98 1.95 0.98 0.99 -0.37 -0.34 0.0 0.5
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23S 10 154 172 U:A cWW   Strong T 2.5 18.7 26.7 13.0 0.8 1.7         0.1 0.3   0.1 0.3 1.1 34.7 759 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 44 44 36 0.82 0.89 0.93 1.82 0.93 0.97 -0.75 -0.72 0.0 0.47
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23S 10 156 170 A:U cWW   Strong T 12.5 7.4 15.4 18.7 1.6 3.2 0.3   0.7 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.4 38.0 759 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 47 53 34 0.68 0.82 0.87 1.69 0.87 0.95 -0.91 -0.92 0.0 0.45
23S 10 157 169 C:G cWW   Strong T 6.2 30.3 11.7 2.0 0.5 5.0 0.7   0.3 0.1 0.4     0.3   2.8 39.7 759 GC,CG,UA,AU,UG,UU GC,CG,UA,AU 37 36 25 0.69 0.67 0.83 1.5 0.83 0.93 -0.72 -0.67 0.0 0.44
23S 10 158 168 U:G cWW   Weak T 0.9 1.2 13.2 0.8   36.6 1.2 0.3 2.1 0.9 0.5   0.4 0.1 0.3 0.3 41.1 759 UA,UG,AG GC,UG,AA 18 23 8 0.39 0.1 0.0 0.1 0.27 0.9 -0.27 -0.52 0.01 0.43
23S 11 183 214 C:G cWW   Strong T   71.8 1.6 0.1   0.1     0.1       0.1 0.1   0.2 25.7 834 CG CG,UA,AU 9 5 2 0.29 0.7 0.99 1.69 0.99 0.99 0.47 0.49 0.0 0.59
23S 11 184 212 C:G cWW   Strong T 10.7 55.4 5.6 0.7 1.9 0.4 0.1   0.1             0.2 24.7 834 GC,CG,UA GC,CG,UA,AU 35 36 29 0.82 0.86 0.96 1.82 0.96 0.99 -0.16 -0.19 0.0 0.6
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23S 12 225 230 C:G cWW   Strong T 0.1 51.3 19.4 3.7 0.1       0.2 0.1   0.1       0.6 24.3 863 CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 18 22 19 0.95 0.95 0.98 1.94 0.98 0.99 -0.14 -0.15 0.0 0.62
23S 12.1 234 430 U:A tWW   Strong T   3.8 69.1 0.1   0.8 0.7 0.1 0.1 0.2     0.1     0.2 24.7 866 CG,UA CG,UA,AU 10 12 6 0.55 0.63 0.97 1.6 0.97 0.98 0.39 0.44 0.01 0.62
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23S 13 237 260 C:G cWW   Strong T 0.3 72.6 6.6 3.1   3.7 0.5 0.1 0.9 0.6 0.6 0.9 0.2   1.0 3.9 4.7 864 CG,UA,AU,UG,UU GC,CG,UA,AU 36 31 12 0.36 0.45 0.87 1.31 0.87 0.91 0.79 0.72 0.01 0.79
23S 13 238 259 C:G cWW   Strong T 13.8 63.6 5.9 4.3 1.4   0.1 0.3   0.2 0.6 0.8 0.1   0.7 4.4 3.7 867 GC,CG,UA,AU,UU GC,CG,UA,AU 48 41 30 0.67 0.73 0.91 1.65 0.91 0.92 0.43 0.32 0.01 0.8
23S 13 239 258 C:G cWW   Significant T 5.7 5.5 22.5 12.1 2.5 21.2 1.4   0.1 4.4 5.9 0.3 0.3 0.2 9.6 4.7 3.3 866 GC,CG,UA,AU,GU,UG,CA,CC,UC,UU UA,AU,CC,GG 88 82 33 0.39 0.25 0.42 0.67 0.47 0.72 0.25 -0.19 0.01 0.8
23S 13 245 253 G:C cWW   Strong T 53.0 3.2 16.1 15.8 3.2 0.1 0.2 5.2   0.5 0.1   0.1 0.1 0.1 0.5 1.7 868 GC,CG,UA,AU,GU,AC GC,CG,UA,AU 23 25 14 0.58 0.78 0.9 1.67 0.9 0.93 0.31 0.35 0.0 0.82
23S 13 246 252 C:G cWW   Strong T 8.4 52.4 6.6 14.4 0.1 15.2 0.1     0.1 0.1 0.1 0.1     0.5 1.8 868 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 43 33 24 0.63 0.64 0.83 1.48 0.83 0.99 0.18 0.49 0.0 0.81
23S 14 265 427 A:U tSS   Strong T 0.2   0.5 72.2 1.0   0.8         0.1     0.1 0.3 24.7 869 AU GC,UA,AU 12 8 4 0.4 0.22 0.97 1.19 0.97 0.98 0.53 0.58 0.0 0.63
23S 14 266 426 G:C cWW   Strong T 71.2   0.1 3.9                       0.1 24.6 868 GC,AU GC,UA,AU 9 9 9 1.0 0.97 1.0 1.97 1.0 1.0 0.45 0.48 0.0 0.63
23S 14 267 425 C:G cWW   Strong T 10.1 57.4 4.0 2.4 0.2 0.3 0.5       0.1   0.1 0.1     24.7 868 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 32 28 25 0.83 0.92 0.98 1.91 0.98 0.99 -0.14 -0.1 0.0 0.63
23S 14 268 424 C:G cWW   Strong T 3.0 59.0 10.2 0.5   1.4 0.3     0.3       0.3   0.2 24.6 869 GC,CG,UA GC,CG,UA,AU 25 27 20 0.77 0.84 0.96 1.8 0.96 0.98 -0.02 0.04 0.0 0.63
23S 16 271 366 G:C cWW   Strong T 3.7 3.7 1.3 1.8 0.1 1.8 0.1 0.3 0.9   0.1   0.2 0.6 2.3 0.8 82.2 872 GC,CG,UC GC,CG,UA,AU 31 16 8 0.34 0.48 0.59 1.07 0.59 0.7 -0.97 -0.79 0.14 0.15
23S 16 272 365 A:U cWW   Strong T 0.5 2.4 1.8 3.9 0.7 1.3 0.3 1.4 0.2 1.5 0.2 0.2 0.6 0.7 0.3 3.3 80.7 871 CG,AU,UU GC,CG,UA,AU 37 19 7 0.25 0.3 0.44 0.75 0.44 0.54 -0.98 -0.79 0.14 0.16

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       s.Xch, s.Ych, s.PE, s.PES, s.Cov1, s.Cov3, s."C1+C3" as C1_C3,
       s.WC, s.WCGU, s.XCons, s.YCons, s.DfDel, s.PNuc
from basepair_frequency f
left join basepair_collective_score s
  on s.molecule = f.molecule and s.position_1 = f.position_1
 and s.position_2 = f.position_2 and s.group_code = f.group_code;
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