Base-pair statistics (frequencies and scores together) (view)

predominant_types
Base-pair types shown in bold in the published table (most frequent).
covarying_types
Base-pair types marked * in the published table (involved in a covariation).
sequences
Number of sequences in the group.

133 rows where conformation = "No BP" and molecule = "23S" sorted by position_1

✎ View and edit SQL

This data as json, CSV (advanced)

Suggested facets: helix_number, position_1, position_2, reference_base_pair, AA, AC, AG, CA, CC, CU, GG, UC, UU, Xch, Ych, PE, Cov3, DfDel

group_code 7

  • 3 19
  • A 19
  • B 19
  • C 19
  • E 19
  • M 19
  • T 19

strength 5

tertiary_type 2

molecule 1

  • 23S · 133 ✖

conformation 1

  • No BP · 133 ✖
molecule helix_number position_1 ▼ position_2 reference_base_pair conformation tertiary_type strength group_code GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap sequences predominant_types covarying_types Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1_C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc
23S 33 687 775 C:G No BP   Weak T   95.8 0.2 0.9   1.2   0.1 0.3 0.1 0.1 0.3 0.1 0.3     0.3 886 CG CG,UA,AU 11 7 0 0.0 0.29 0.97 1.27 0.97 0.98 1.72 1.8 0.0 0.84
23S 33 687 775 C:G No BP   Weak 3   99.0               0.2 0.2     0.4     0.2 524 CG   2 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.96 1.94 0.0 0.83
23S 33 687 775 C:G No BP   Weak B   99.3               0.4 0.4             282 CG   0 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 2.0 1.93 0.0 0.86
23S 33 687 775 C:G No BP   Weak A   100.0                               37 CG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.9
23S 33 687 775 C:G No BP   Weak C   95.0             2.0     3.0           100 CG,AG,CU   1 2 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.95 1.86 1.81 0.0 0.97
23S 33 687 775 C:G No BP   Weak E   98.5                       1.0     0.5 205 CG   2 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.92 1.95 0.0 0.78
23S 33 687 775 C:G No BP   Weak M   89.7 0.8 3.1   4.2   0.4 0.4       0.4 0.4     0.8 262 CG,AU,UG CG,UA,AU 8 4 0 0.0 0.4 0.94 1.34 0.94 0.98 1.34 1.62 0.01 0.83
23S 33 688 774 U:G No BP   Significant T     90.9 1.5 0.1 3.6       0.1         3.3 0.3 0.2 886 UA,UG,UC UA,AU 4 14 3 0.33 0.17 0.0 0.17 0.93 0.96 1.84 1.42 0.0 0.85
23S 33 688 774 U:G No BP   Significant 3     89.5     5.3                 5.0 0.2   524 UA,UG,UC   0 7 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.95 2.0 1.4 0.0 0.83
23S 33 688 774 U:G No BP   Significant B     88.7     9.2                 2.1     282 UA,UG,UC   0 4 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.98 2.0 1.41 0.0 0.86
23S 33 688 774 U:G No BP   Significant A     100.0                             37 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.9
23S 33 688 774 U:G No BP   Significant C     100.0                             100 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.97
23S 33 688 774 U:G No BP   Significant E     88.8     1.0                 9.8 0.5   205 UA,UC   0 3 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.9 2.0 1.42 0.0 0.78
23S 33 688 774 U:G No BP   Significant M     90.1 5.0 0.4 1.5       0.4         1.1 0.8 0.8 262 UA,AU UA,AU 4 7 3 0.55 0.54 0.96 1.5 0.96 0.98 1.56 1.41 0.01 0.83
23S 34 703 729 U:G No BP   Weak T   15.1 0.1 0.1 0.1 71.4 0.2   5.1 0.1   0.1   0.6     7.1 887 CG,UG,AG GU,UG,AA 40 4 1 0.04 0.02 0.0 0.02 0.17 0.93 0.55 1.49 0.01 0.79
23S 34 703 729 U:G No BP   Weak 3   22.5       77.3       0.2               524 CG,UG UG,CA 20 0 0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.23 1.0 1.23 1.98 0.0 0.83
23S 34 703 729 U:G No BP   Weak B   1.8       98.2                       282 UG   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 1.87 2.0 0.0 0.86
23S 34 703 729 U:G No BP   Weak A   32.4       67.6                       37 CG,UG   3 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 1.0 1.09 2.0 0.0 0.9
23S 34 703 729 U:G No BP   Weak C           100.0                       100 UG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.97
23S 34 703 729 U:G No BP   Weak E   49.3       50.2       0.5               205 CG,UG UG,CA 16 0 0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.49 0.99 1.0 1.96 0.0 0.78
23S 34 703 729 U:G No BP   Weak M   6.1 0.4 0.4 0.4 48.7 0.8   17.1     0.4   1.9     24.0 263 CG,UG,AG GU,UG,AA 20 4 1 0.08 0.04 0.0 0.04 0.09 0.73 -0.3 0.73 0.04 0.64
23S 55 1420 1578 A:U No BP   Strong T 4.5 10.9 5.9 7.0 0.8 0.2 0.1 0.2 0.6 0.2   0.8       22.3 46.3 860 GC,CG,UA,AU,UU GC,CG,AA,UU 29 38 14 0.42 0.5 0.71 1.2 0.53 0.55 -0.83 -0.73 0.1 0.44
23S 55 1420 1578 A:U No BP   Strong 3 8.1 18.8 9.1 10.5 1.0 0.4   0.2 0.8 0.4   1.2       39.5 9.8 484 GC,CG,UA,AU,UU GC,CG,UU 26 22 11 0.46 0.53 0.74 1.27 0.52 0.53 -0.18 -0.05 0.02 0.69
23S 55 1420 1578 A:U No BP   Strong B       11.4 0.4 0.8     1.5     2.3       72.3 11.5 264 AU,CU,UU AG,UU 13 7 0 0.0 0.09 0.0 0.09 0.13 0.14 0.55 1.05 0.03 0.72
23S 55 1420 1578 A:U No BP   Strong A 39.0     29.3 7.3                       24.4 41 GC,AU,GU GC,AU 3 3 3 1.0 0.8 0.9 1.7 0.9 1.0 -0.02 -0.04 0.0 0.76
23S 55 1420 1578 A:U No BP   Strong C     3.0 3.0 2.0   1.0 1.0       1.0       1.0 88.0 100 UA,AU,GU UA,AU 1 14 1 0.13 0.33 0.5 0.83 0.5 0.67 -0.5 0.6 0.85 0.12
23S 55 1420 1578 A:U No BP   Strong E 12.8 50.8 24.6 5.0 0.6     0.6   1.1             4.6 179 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 10 12 8 0.73 0.95 0.98 1.93 0.98 0.98 0.11 0.15 0.01 0.65
23S 55 1420 1578 A:U No BP   Strong M   1.1 1.4 2.2         0.4               94.9 276 AU CG,UA,AU 2 2 2 1.0 0.88 0.93 1.8 0.93 0.93 -0.29 -0.31 0.0 0.04
23S 59 1527 1544 G:A No BP 3°: base pair Strong T 1.9 18.8 3.7 1.6 7.7 0.3 1.0   0.2 2.8 0.2 0.1 20.0 0.2 0.1 0.3 40.8 861 CG,UA,GU,CA,GA CG,AU,GA,UC 29 16 12 0.53 0.53 0.69 1.21 0.44 0.58 -0.71 -0.76 0.0 0.49
23S 59 1527 1544 G:A No BP 3°: base pair Strong 3 2.9 32.6 4.7 0.4 13.4   0.8   0.2       33.8 0.2   0.4 10.4 485 GC,CG,UA,GU,GA CG,AU,GA 15 10 6 0.48 0.59 0.75 1.34 0.45 0.6 0.12 -0.1 0.0 0.69
23S 59 1527 1544 G:A No BP 3°: base pair Strong B 3.4 13.6 5.7 0.4 2.7   1.5           62.1     0.8 9.9 264 GC,CG,UA,GU,GA CG,GA,UU 9 3 1 0.17 0.51 0.85 1.36 0.26 0.29 0.36 0.4 0.0 0.73
23S 59 1527 1544 G:A No BP 3°: base pair Strong A         73.2                       26.8 41 GU   0 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.57 0.56 0.07 0.73
23S 59 1527 1544 G:A No BP 3°: base pair Strong C 2.0 4.0 9.0 11.0 1.0 3.0 5.0   1.0 24.0 2.0 1.0 8.0 1.0 1.0 1.0 26.0 100 GC,CG,UA,AU,UG,AA,CA,CC,GA GC,AU,UG,CA 14 6 6 0.6 0.32 0.54 0.86 0.35 0.41 -0.63 -0.43 0.05 0.72
23S 59 1527 1544 G:A No BP 3°: base pair Strong E 2.8 67.8 4.4 0.6 15.6       0.6         0.6     7.8 180 GC,CG,UA,GU CG,UA,GU 6 6 5 0.83 0.82 0.95 1.77 0.82 0.99 0.46 0.57 0.01 0.63
23S 59 1527 1544 G:A No BP 3°: base pair Strong M       0.4                         99.7 276     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 -0.03 -0.06 0.0 0.0
23S 66 1799 1820 G:U No BP   Weak T 22.1   0.1 0.6 73.2     0.1         0.4       3.5 842 GC,GU UA,GU,AC 3 10 1 0.15 0.01 0.0 0.01 0.24 0.99 1.63 0.93 0.0 0.78
23S 66 1799 1820 G:U No BP   Weak 3 40.0       58.3     0.2                 1.5 458 GC,GU GU,AC 0 4 0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.41 1.0 1.83 0.9 0.0 0.72
23S 66 1799 1820 G:U No BP   Weak B         100.0                         262 GU   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.8
23S 66 1799 1820 G:U No BP   Weak A 90.2       9.8                         41 GC,GU   0 2 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 1.0 2.0 1.54 0.0 1.0
23S 66 1799 1820 G:U No BP   Weak C 1.0       96.0               3.0         101 GU,GA   0 3 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.97 2.0 1.73 0.0 0.98
23S 66 1799 1820 G:U No BP   Weak E 97.4       0.6     0.6                 1.2 155 GC   0 2 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.82 1.78 0.0 0.58
23S 66 1799 1820 G:U No BP   Weak M 0.7   0.4 1.8 89.0                       8.1 283 GU UA,GU 3 3 1 0.33 0.12 0.0 0.12 0.03 1.0 1.27 1.37 0.0 0.83
23S 69 1911 1919 U:A No BP   Weak T     97.9             0.5           0.1 1.5 852 UA   2 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.82 1.86 0.0 0.8
23S 69 1911 1919 U:A No BP   Weak 3     98.6             0.9           0.2 0.2 440 UA   2 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.9 1.98 0.0 0.7
23S 69 1911 1919 U:A No BP   Weak B     98.0             1.6             0.4 244 UA   2 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.98 1.83 1.95 0.0 0.74
23S 69 1911 1919 U:A No BP   Weak A     100.0                             41 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 1.0
23S 69 1911 1919 U:A No BP   Weak C     100.0                             101 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.98
23S 69 1911 1919 U:A No BP   Weak E     99.4                         0.6   155 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 2.0 1.94 0.0 0.59
23S 69 1911 1919 U:A No BP   Weak M     96.1                           3.8 311 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.71 1.71 0.0 0.96
23S 71 1935 1962 G:C No BP   Strong T 51.6 20.5   16.5 5.7 0.2 0.2 2.6 1.1       0.2 0.7 0.2 0.4   847 GC,CG,AU,GU,AC GC,CG,AU 21 23 8 0.36 0.77 0.89 1.65 0.89 0.95 0.55 0.52 0.0 0.81
23S 71 1935 1962 G:C No BP   Strong 3 56.9 39.9     2.5 0.5   0.2                   436 GC,CG,GU GC,CG 4 3 2 0.57 0.93 0.97 1.89 0.97 1.0 0.97 0.88 0.0 0.69
23S 71 1935 1962 G:C No BP   Strong B 99.6         0.4                       240 GC GC,UG 1 1 1 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.96 1.91 0.0 0.74
23S 71 1935 1962 G:C No BP   Strong A 22.0 51.2     26.8                         41 GC,CG,GU CG,GU 1 1 0 0.0 0.55 0.78 1.33 0.73 1.0 1.0 0.52 0.0 1.0
23S 71 1935 1962 G:C No BP   Strong C 97.0             2.0           1.0       101 GC,AC   1 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.97 1.86 1.92 0.0 0.98
23S 71 1935 1962 G:C No BP   Strong E   98.7       0.6   0.6                   155 CG CG,AC 2 1 1 0.67 0.5 0.99 1.49 0.99 0.99 1.89 1.94 0.0 0.59
23S 71 1935 1962 G:C No BP   Strong M 29.4     45.2 11.9   0.6 6.1 2.9       0.6 1.6 0.6 1.0   310 GC,AU,GU,AC,AG GC,AU 16 19 6 0.34 0.54 0.74 1.28 0.74 0.86 0.91 0.73 0.0 0.99
23S 74 2075 2434 U:A No BP   Weak T   0.1 97.8     0.4 0.2         0.1     0.2 1.2   845 UA CG,UA 4 8 3 0.5 0.05 0.0 0.05 0.98 0.98 1.94 1.83 0.0 0.81
23S 74 2075 2434 U:A No BP   Weak 3     99.3                         0.7   437 UA   0 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 2.0 1.94 0.0 0.69
23S 74 2075 2434 U:A No BP   Weak B     100.0                             241 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.74
23S 74 2075 2434 U:A No BP   Weak A     100.0                             41 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 1.0
23S 74 2075 2434 U:A No BP   Weak C     100.0                             99 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.96
23S 74 2075 2434 U:A No BP   Weak E     98.1                         1.9   155 UA   0 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.98 2.0 1.86 0.0 0.59
23S 74 2075 2434 U:A No BP   Weak M   0.3 94.8     1.0 0.6         0.3     0.6 2.3   309 UA,UU CG,UA 4 7 3 0.55 0.06 0.0 0.06 0.95 0.96 1.85 1.67 0.0 0.99
23S 76.1 2112 2169 G:A No BP 3°: pseudoknot Strong T 0.1 0.2 0.9 1.1 0.5   1.3   11.0 0.1     53.0   0.1   31.6 847 AG,GA AG,GA,UC 14 10 9 0.75 0.72 0.94 1.66 0.04 0.04 -0.13 -0.1 0.0 0.55
23S 76.1 2112 2169 G:A No BP 3°: pseudoknot Strong 3 0.2     2.1 0.9       20.1       76.7         437 AU,AG,GA AG,GA 8 8 7 0.88 0.86 0.97 1.83 0.02 0.03 1.24 1.07 0.0 0.69
23S 76.1 2112 2169 G:A No BP 3°: pseudoknot Strong B                 34.4       65.6         241 AG,GA AG,GA 2 2 2 1.0 1.0 1.0 2.0 0.0 0.0 1.07 1.07 0.0 0.74
23S 76.1 2112 2169 G:A No BP 3°: pseudoknot Strong A       4.9         12.2       82.9         41 AU,AG,GA AG,GA 3 3 3 1.0 0.71 0.95 1.67 0.05 0.05 1.34 1.19 0.0 1.0
23S 76.1 2112 2169 G:A No BP 3°: pseudoknot Strong C             3.0           97.0         101 AA,GA   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.81 2.0 0.0 0.98
23S 76.1 2112 2169 G:A No BP 3°: pseudoknot Strong E 0.6     4.5 2.6               92.3         155 AU,GU,GA AU,GA 3 3 2 0.67 0.58 0.97 1.55 0.05 0.08 1.74 1.57 0.0 0.59
23S 76.1 2112 2169 G:A No BP 3°: pseudoknot Strong M   0.6 2.6       2.6   1.6 0.3     5.2   0.3   86.7 309 UA,AA,GA AG,GA,UC 5 2 2 0.57 0.24 0.54 0.78 0.24 0.24 -0.54 -0.42 0.0 0.13
23S 76.1 2113 2170 U:A No BP 3°: pseudoknot Strong T   26.0 37.7     1.1 0.1     1.8     1.3     0.1 32.0 847 CG,UA CG,UA 15 14 8 0.55 0.86 0.94 1.79 0.94 0.95 -0.3 -0.21 0.0 0.55
23S 76.1 2113 2170 U:A No BP 3°: pseudoknot Strong 3   27.5 66.8     0.9       2.5     2.1     0.2   437 CG,UA,CA,GA CG,UA 11 10 7 0.67 0.83 0.94 1.77 0.94 0.95 0.98 1.11 0.0 0.69
23S 76.1 2113 2170 U:A No BP 3°: pseudoknot Strong B   41.9 53.9             1.7     2.5         241 CG,UA,GA CG,UA 7 5 5 0.83 0.91 0.96 1.87 0.96 0.96 0.86 1.02 0.0 0.74
23S 76.1 2113 2170 U:A No BP 3°: pseudoknot Strong A   29.3 48.8             17.1     4.9         41 CG,UA,CA,GA CG,UA 2 1 0 0.0 0.57 0.78 1.35 0.78 0.78 0.77 1.13 0.0 1.0
23S 76.1 2113 2170 U:A No BP 3°: pseudoknot Strong C   96.0 3.0             1.0               101 CG,UA CG,UA 1 2 1 0.67 0.75 0.99 1.74 0.99 0.99 1.81 1.76 0.0 0.98
23S 76.1 2113 2170 U:A No BP 3°: pseudoknot Strong E   4.5 91.6     2.6             0.6     0.6   155 CG,UA,UG CG,UA 2 4 2 0.67 0.54 0.96 1.5 0.96 0.99 1.68 1.57 0.0 0.59
23S 76.1 2113 2170 U:A No BP 3°: pseudoknot Strong M   1.0 7.8     1.6 0.3     1.0     0.6       87.7 309 UA CG,UA 3 2 0 0.0 0.21 0.71 0.93 0.71 0.84 -0.42 -0.42 0.01 0.12
23S 76.1 2117 2172 A:U No BP 3°: pseudoknot Strong T 5.4 7.7 0.6 49.2 0.4   0.7   0.5 0.4   0.2 0.8     2.5 31.6 847 GC,CG,AU,UU GC,CG,UA,AU 14 15 9 0.62 0.72 0.92 1.64 0.92 0.93 -0.37 -0.3 0.0 0.55
23S 76.1 2117 2172 A:U No BP 3°: pseudoknot Strong 3 8.9     88.8 0.2         0.7   0.5 0.9         437 GC,AU GC,AU,CA 5 4 2 0.44 0.86 0.98 1.84 0.98 0.98 1.44 1.45 0.0 0.69
23S 76.1 2117 2172 A:U No BP 3°: pseudoknot Strong B       100.0                           241 AU   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.74
23S 76.1 2117 2172 A:U No BP 3°: pseudoknot Strong A 85.4     14.6                           41 GC,AU GC,AU 1 1 1 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.4 1.4 0.0 1.0
23S 76.1 2117 2172 A:U No BP 3°: pseudoknot Strong C 2.0 64.4   11.9 1.0                     20.8   101 GC,CG,AU,UU GC,CG,UU 5 4 4 0.89 0.64 0.87 1.51 0.78 0.79 0.6 0.95 0.0 0.98
23S 76.1 2117 2172 A:U No BP 3°: pseudoknot Strong E 2.6     91.0 0.6         1.9   1.3 2.6         155 GC,AU,GA GC,AU,CA 4 3 1 0.29 0.29 0.94 1.22 0.94 0.94 1.48 1.56 0.0 0.59
23S 76.1 2117 2172 A:U No BP 3°: pseudoknot Strong M 1.6   1.6 5.5 0.3   1.9   1.3       1.0       86.7 309 AU GC,UA,AU 4 7 3 0.55 0.42 0.66 1.07 0.66 0.68 -0.47 -0.54 0.0 0.13
23S 80 2249 2255 U:G No BP   Weak T     4.1     94.6       0.6       0.4 0.1 0.1 0.1 845 UA,UG UG,CA 2 10 1 0.17 0.11 0.0 0.11 0.04 0.99 1.91 1.68 0.0 0.81
23S 80 2249 2255 U:G No BP   Weak 3           99.1               0.7     0.2 434 UG   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 1.94 1.97 0.0 0.69
23S 80 2249 2255 U:G No BP   Weak B           99.6                     0.4 238 UG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 2.0 1.95 0.0 0.73
23S 80 2249 2255 U:G No BP   Weak A           100.0                       41 UG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 2.0 2.0 0.0 1.0
23S 80 2249 2255 U:G No BP   Weak C     2.0     98.0                       102 UA,UG   0 2 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 2.0 1.86 0.0 0.99
23S 80 2249 2255 U:G No BP   Weak E           98.1               1.9       155 UG   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 1.86 2.0 0.0 0.59
23S 80 2249 2255 U:G No BP   Weak M     10.7     87.1       1.6         0.3 0.3   309 UA,UG UG,CA 1 8 1 0.22 0.12 0.0 0.12 0.11 0.98 1.88 1.4 0.0 0.99
23S 84 2296 2322 U:A No BP   Strong T   0.4 63.4 0.1   0.2 0.1 0.1   0.1 0.1   0.5   2.7 0.5 31.7 848 UA,UC CG,UA,AU 5 11 3 0.38 0.1 0.0 0.1 0.94 0.94 0.34 0.19 0.0 0.55
23S 84 2296 2322 U:A No BP   Strong 3     92.9         0.2   0.2     0.9   5.0 0.7   437 UA,UC UA,AC 1 5 0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.93 0.93 1.88 1.64 0.0 0.69
23S 84 2296 2322 U:A No BP   Strong B     96.7                       2.5 0.8   241 UA,UC   0 3 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.97 1.95 1.76 0.0 0.74
23S 84 2296 2322 U:A No BP   Strong A     100.0                             41 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 1.0
23S 84 2296 2322 U:A No BP   Strong C     99.0                           1.0 102 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.9 1.9 0.0 0.98
23S 84 2296 2322 U:A No BP   Strong E     85.2         0.6   0.6     2.6   10.3 0.6   155 UA,GA,UC UA,AC 1 2 0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.85 0.85 1.72 1.45 0.0 0.59
23S 84 2296 2322 U:A No BP   Strong M   1.0 10.0 0.3   0.6 0.3       0.3       0.3 0.3 86.7 309 UA CG,UA,AU 4 6 3 0.6 0.4 0.85 1.25 0.85 0.9 -0.4 -0.46 0.01 0.13
23S 90 2511 2577 U:A No BP   No Support T     99.1             0.9               778 UA   2 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.93 2.0 0.0 0.74
23S 90 2511 2577 U:A No BP   No Support 3     100.0                             417 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.66

Next page

Advanced export

JSON shape: default, array, newline-delimited

CSV options: 

CREATE VIEW basepair_combined as
select f.molecule, f.helix_number, f.position_1, f.position_2,
       f.reference_base_pair, f.conformation, f.tertiary_type, f.strength, f.group_code,
       f.GC, f.CG, f.UA, f.AU, f.GU, f.UG, f.AA, f.AC, f.AG, f.CA, f.CC, f.CU, f.GA, f.GG, f.UC, f.UU, f.gap, f.Seq as sequences,
       f.predominant_types, f.covarying_types,
       s.Xch, s.Ych, s.PE, s.PES, s.Cov1, s.Cov3, s."C1+C3" as C1_C3,
       s.WC, s.WCGU, s.XCons, s.YCons, s.DfDel, s.PNuc
from basepair_frequency f
left join basepair_collective_score s
  on s.molecule = f.molecule and s.position_1 = f.position_1
 and s.position_2 = f.position_2 and s.group_code = f.group_code;