Base-pair statistics (frequencies and scores together) (view)

predominant_types
Base-pair types shown in bold in the published table (most frequent).
covarying_types
Base-pair types marked * in the published table (involved in a covariation).
sequences
Number of sequences in the group.

782 rows where group_code = "M", molecule = "23S" and strength = "Strong" sorted by position_1

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Suggested facets: reference_base_pair, CC, CU, GG, UC, PE

conformation 9

strength 1

  • Strong · 782 ✖

molecule 1

  • 23S · 782 ✖

group_code 1

molecule helix_number position_1 ▼ position_2 reference_base_pair conformation tertiary_type strength group_code GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap sequences predominant_types covarying_types Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1_C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc
23S 1 1 2902 G:C cWW   Strong M 5.9   26.5 26.5 5.9 5.9 2.9 2.9             2.9 2.9 17.6 34 GC,UA,AU,GU,UG,AA,AC,UC,UU GC,UA,AU 6 9 5 0.67 0.58 0.71 1.29 0.71 0.86 -0.64 -0.71 0.02 0.09
23S 1 2 2901 G:C cWW   Strong M 14.7 2.9 17.6 23.5 5.9       2.9   2.9   5.9     5.9 17.6 34 GC,CG,UA,AU,GU,AG,CC,GA,UU GC,CG,UA,AU 9 7 4 0.5 0.6 0.71 1.31 0.71 0.79 -0.88 -0.77 0.02 0.09
23S 1 3 2900 U:A cWW   Strong M   2.9 23.5 47.1       2.9       2.9     2.9   17.6 34 CG,UA,AU,AC,CU,UC CG,UA,AU 4 6 7 1.0 0.75 0.89 1.64 0.89 0.89 -0.52 -0.49 0.02 0.09
23S 1 4 2899 U:A cWW   Strong M 8.8 2.9 29.4 23.5 2.9 2.9 5.9           2.9     2.9 17.6 34 GC,CG,UA,AU,GU,UG,AA,GA,UU GC,CG,UA,AU 7 5 4 0.67 0.67 0.79 1.45 0.79 0.86 -0.78 -0.68 0.02 0.09
23S 1 5 2898 A:U cWW   Strong M 8.8 5.9 11.8 35.3 2.9 5.9                 2.9 5.9 20.5 34 GC,CG,UA,AU,GU,UG,UC,UU GC,CG,UA,AU 8 7 5 0.67 0.6 0.78 1.38 0.78 0.89 -0.8 -0.71 0.01 0.09
23S 1 6 2897 A:U cWW   Strong M 5.9   29.4 26.5     5.9           5.9     5.9 20.5 34 GC,UA,AU,AA,GA,UU GC,UA,AU 8 6 7 1.0 0.65 0.78 1.43 0.78 0.78 -0.64 -0.47 0.01 0.09
23S 1 7 2896 G:C cWW   Strong M 5.9 5.9 14.7 38.2 5.9   2.9           5.9       20.5 34 GC,CG,UA,AU,GU,AA,GA GC,CG,UA,AU 8 5 5 0.77 0.64 0.81 1.46 0.81 0.89 -0.78 -0.62 0.01 0.09
23S 2 15 525 G:U cWW   Strong M 44.2 0.4 2.7 32.3 8.0 0.4 4.0 0.4 2.2       0.4   0.4   4.4 226 GC,UA,AU,GU,AA,AG GC,CG,UA,AU 17 24 14 0.68 0.69 0.83 1.52 0.83 0.92 0.49 -0.03 0.05 0.69
23S 2 16 524 C:G cWW   Strong M 3.5 69.7 8.8 8.8 1.3 1.8 1.3 0.4                 4.4 228 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 12 14 9 0.69 0.81 0.95 1.76 0.95 0.98 0.46 0.22 0.05 0.7
23S 2 17 523 G:C cWW   Strong M 7.9 0.4 0.9 5.3 4.8     0.4   0.4     0.4     0.4 79.0 228 GC,AU,GU GC,CG,UA,AU 8 13 4 0.38 0.5 0.69 1.19 0.69 0.92 -0.61 0.35 0.49 0.15
23S 2 18 522 U:A cWW   Strong M 1.3 7.9 5.3 4.4     0.4             0.4     80.2 228 CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 8 20 8 0.57 0.93 0.96 1.88 0.96 0.96 -0.69 0.21 0.5 0.14
23S 2 19 521 A:U cWW   Strong M 0.4 3.5 3.9 10.1 0.4                     0.9 80.7 228 CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 5 15 6 0.6 0.86 0.93 1.79 0.93 0.95 -0.64 -0.2 0.48 0.14
23S 2 20 520 C:G cWW   Strong M   2.2 11.0 5.3 0.4                       81.1 228 CG,UA,AU CG,UA,AU 9 11 10 1.0 0.94 0.98 1.92 0.98 1.0 -0.6 -0.61 0.05 0.14
23S 2 21 519 A:U cWW   Strong M 0.4 1.3 5.7 6.1   3.1     0.4             0.9 82.1 228 UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 9 10 9 0.95 0.63 0.76 1.39 0.76 0.93 -0.58 -0.67 0.05 0.13
23S 2 22 518 C:G cWW   Strong M 3.1 3.1 0.9 4.4   5.7 0.4           0.4       81.9 228 GC,CG,AU,UG GC,AU,UG 6 8 3 0.43 0.61 0.73 1.34 0.63 0.95 -0.67 -0.72 0.05 0.13
23S 2 23 517 G:C cWW   Strong M 4.8 1.3 3.9 7.5     0.4                   82.0 228 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 6 7 6 0.92 0.96 0.98 1.93 0.98 0.98 -0.64 -0.68 0.06 0.13
23S 2 24 516 G:C cWW   Strong M 3.5     14.0                         82.4 228 GC,AU GC,AU 3 5 2 0.5 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 -0.45 -0.57 0.06 0.13
23S 2 30 510 G:C cWW 3°: base pair Strong M 10.0 0.4 2.2 4.8 0.4                     0.4 81.6 229 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 26 8 5 0.29 0.9 0.95 1.85 0.95 0.98 0.02 -0.6 0.64 0.14
23S 3 31 474 C:G cWW   Strong M 26.0 8.2 21.2 7.4   0.4 2.6 1.3 0.9 16.5 0.9   6.9 0.4 0.4 1.3 5.6 231 GC,CG,UA,AU,AA,CA,GA GC,CG,UA,AU 37 20 14 0.49 0.54 0.67 1.2 0.67 0.67 -0.18 -0.1 0.02 0.7
23S 3 32 473 C:G cWW   Strong M   79.3 3.9 2.6 0.4 1.7 0.4     4.3 0.4 0.4     0.4 0.4 5.6 232 CG,UA,AU,CA CG,UA,AU 13 13 7 0.54 0.43 0.91 1.34 0.91 0.93 1.07 0.63 0.02 0.7
23S 4 35 445 G:C cWW   Strong M 85.0     3.9   0.9 0.9                 0.9 8.5 233 GC,AU GC,AU,UG 11 9 7 0.7 0.73 0.98 1.72 0.97 0.98 1.12 0.68 0.08 0.68
23S 4 36 444 G:C cWW   Strong M 7.7 73.0 1.7 6.0 0.9   0.4     0.4     0.9       9.0 233 GC,CG,AU GC,CG,UA,AU 10 10 7 0.7 0.86 0.97 1.83 0.97 0.98 0.57 0.2 0.08 0.68
23S 4 37 442 C:G cWW   Strong M 1.3 48.5 31.3 4.3   3.4 0.4     0.4             10.3 233 CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 20 16 14 0.78 0.9 0.95 1.85 0.95 0.99 0.27 -0.06 0.09 0.67
23S 4 38 441 A:U cWW   Strong M 0.4 42.9 26.6 14.2 1.3 2.1 0.9     0.9   0.4         10.2 233 CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 17 19 15 0.83 0.88 0.94 1.82 0.94 0.98 0.03 -0.24 0.09 0.67
23S 4 39 440 G:C cWW   Strong M 3.4 1.3 18.5 28.3     5.2 6.0   0.9 3.4 2.6 1.3     1.7 27.5 233 GC,UA,AU,AA,AC,CC,CU GC,CG,UA,AU 24 33 20 0.7 0.49 0.69 1.19 0.71 0.71 -0.48 -0.62 0.08 0.54
23S 4 40 439 U:A cWW   Strong M 1.3 0.4 10.7 7.7 0.4                       79.3 233 UA,AU GC,CG,UA,AU 6 7 6 0.92 0.96 0.98 1.94 0.98 1.0 -0.64 -0.64 0.04 0.15
23S 4 41 438 C:G cWW   Strong M 2.1 0.9 6.4 7.7 0.4 0.4                     82.0 233 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 7 5 5 0.83 0.92 0.95 1.87 0.95 1.0 -0.66 -0.62 0.07 0.14
23S 4 42 437 A:U cWW   Strong M 3.0 0.9 2.1 11.6                         82.5 233 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 6 5 5 0.91 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 -0.61 -0.55 0.08 0.13
23S 4 43 436 G:C cWW   Strong M 4.7   4.7 8.2           0.4             82.0 233 GC,UA,AU GC,UA,AU 7 6 6 0.92 0.96 0.98 1.93 0.98 0.98 -0.64 -0.58 0.08 0.14
23S 4 44 434 A:U cWW   Strong M 2.1   7.3 6.0   0.4               0.9   1.3 81.9 233 GC,UA,AU GC,UA,AU 10 9 7 0.74 0.76 0.86 1.62 0.86 0.88 -0.62 -0.61 0.07 0.14
23S 4 45 433 G:C cWW   Strong M 0.9 0.4 6.0 8.6   0.9   0.4             0.4 0.4 81.9 233 UA,AU GC,CG,UA,AU 9 9 7 0.78 0.77 0.88 1.65 0.88 0.93 -0.57 -0.59 0.07 0.14
23S 4.1 46 179 G:C cWW   Strong M 1.7   0.4 1.7     1.3   0.4 1.3     2.1   0.4 2.1 88.3 233 GA,UU AG,GA,UU 9 6 5 0.67 0.27 0.41 0.68 0.33 0.33 -0.63 -0.49 0.08 0.09
23S 4.1 47 178 C:G cWW   Strong M 0.4   0.4 0.9 2.1                       96.1 233 GU UA,GU 5 1 1 0.33 0.25 0.67 0.92 0.44 1.0 -0.51 -0.26 0.08 0.03
23S 5 54 116 G:C cWW   Strong M 7.3 0.4 1.7 4.3                         86.3 233 GC,AU GC,CG,UA,AU 9 7 7 0.88 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 -0.58 -0.54 0.02 0.1
23S 5 55 115 G:C cWW   Strong M 9.9 0.9   1.7 0.9       0.4       0.4       85.8 233 GC GC,CG,AU 6 3 2 0.44 0.6 0.88 1.48 0.88 0.94 -0.5 -0.48 0.03 0.11
23S 5 56 114 A:U cWW   Strong M 1.3   1.7 7.7   1.3 0.9 0.4 0.4             0.4 85.9 233 AU GC,UA,AU 7 6 6 0.92 0.47 0.76 1.22 0.76 0.85 -0.55 -0.54 0.02 0.11
23S 6 57 70 C:G cWW   Strong M 0.9 9.0 1.3 4.7     0.4     0.4             83.3 233 CG,AU GC,CG,UA,AU 6 5 6 1.0 0.89 0.95 1.84 0.95 0.95 -0.57 -0.58 0.0 0.12
23S 6 58 69 G:C cWW   Strong M 10.3   3.0 1.3 0.4   0.4 1.3                 83.3 233 GC,UA GC,UA,AU 2 4 2 0.67 0.67 0.87 1.54 0.87 0.9 -0.54 -0.51 0.0 0.12
23S 6 59 68 U:G cWW   Strong M   3.9 6.0 4.3   1.7 0.4 0.4                 83.3 233 CG,UA,AU CG,UA,AU 6 6 6 1.0 0.76 0.85 1.61 0.85 0.95 -0.57 -0.6 0.0 0.12
23S 6.1 61 93 C:G cWW 3°: pseudoknot Strong M     0.4 0.9     1.3   0.9   0.4   0.9 0.9 0.4 2.6 91.5 233 UU AA,CC,GG,UU 9 6 5 0.67 0.43 0.6 1.03 0.15 0.15 -0.55 -0.5 0.02 0.06
23S 6.1 62 92   cWW 3°: pseudoknot Strong M   0.4 0.9 2.1 0.4 1.3 2.1       0.9 0.9 0.4 0.4   2.1 88.0 233 AU,AA,UU AU,UG,CC,GA 9 6 3 0.4 0.35 0.46 0.81 0.29 0.43 -0.59 -0.53 0.02 0.09
23S 6.1 65 89 U:A cWW 3°: pseudoknot Strong M 0.4 0.4 0.4 1.3     0.4 0.4 1.3 0.4     2.6       92.1 233 GA AG,GA 6 4 2 0.4 0.25 0.5 0.75 0.33 0.33 -0.49 -0.46 0.01 0.06
23S 6.2 67 74 U:A cWH 3°: pseudoknot Strong M 1.3   2.6 3.0 0.4   1.7 0.4 0.4 0.4   1.3 1.7 1.7   0.9 84.1 233 UA,AU UA,AU,GG 8 6 2 0.29 0.33 0.46 0.79 0.43 0.46 -0.61 -0.62 0.0 0.12
23S 7 76 110 C:G cWW   Strong M 2.1 3.8 5.1 0.4   0.9 0.9   0.4             0.4 86.0 234 GC,CG,UA GC,CG,UA,AU 8 5 2 0.31 0.71 0.82 1.53 0.82 0.88 -0.61 -0.55 0.02 0.11
23S 7 77 109 G:C cWW   Strong M 1.3 4.3 3.8 3.8   0.9                     86.0 234 CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 8 7 7 0.93 0.91 0.94 1.85 0.94 1.0 -0.62 -0.57 0.02 0.11
23S 7 78 108 U:G cWW   Strong M 1.3   2.6 9.4 0.4   0.4                   85.9 234 UA,AU GC,UA,AU 4 5 4 0.89 0.82 0.94 1.76 0.94 0.97 -0.5 -0.47 0.02 0.11
23S 7 79 107 C:G cWW   Strong M 1.3 0.9 6.8 3.4   1.7                     85.8 234 UA,AU GC,CG,UA,AU 4 5 2 0.44 0.77 0.88 1.64 0.88 1.0 -0.59 -0.55 0.02 0.11
23S 7 80 106 G:C cWW   Strong M 3.8 1.3 1.7 6.4 0.9 0.4                     85.4 234 GC,AU GC,CG,UA,AU 9 7 7 0.88 0.84 0.91 1.75 0.91 1.0 -0.6 -0.56 0.02 0.11
23S 7 81 105 G:C cWW   Strong M 4.3 0.4 2.6 3.0 0.4 0.9 0.4 0.4                 87.6 234 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 6 2 2 0.5 0.74 0.83 1.56 0.83 0.93 -0.56 -0.57 0.0 0.09
23S 7 82 104 U:A tSH   Strong M     3.8 1.7 3.8 0.4 0.4   0.4             0.9 88.4 234 UA,GU UA,GU,AG 4 2 1 0.33 0.56 0.7 1.26 0.48 0.85 -0.56 -0.45 0.01 0.09
23S 7 85 97 G:C cWW   Strong M     2.6 8.1       0.4 0.4       0.4       88.1 234 UA,AU UA,AU 3 2 1 0.4 0.67 0.89 1.56 0.89 0.89 -0.5 -0.43 0.02 0.09
23S 7 86 96 G:C cWW   Strong M 4.7 1.3 2.1 3.0   0.4 0.4                   88.1 234 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 5 4 4 0.89 0.88 0.93 1.81 0.93 0.96 -0.59 -0.52 0.02 0.09
23S 7 87 95 U:A cWW   Strong M 2.1 0.9 2.1 4.3   0.4 0.9                   89.3 234 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 7 4 4 0.73 0.8 0.88 1.68 0.88 0.92 -0.54 -0.48 0.02 0.08
23S 8 121 130 G:C cWW   Strong M 3.8 3.0 0.4 3.4     0.9         0.4         88.0 234 GC,CG,AU GC,CG,UA,AU 5 6 5 0.91 0.84 0.89 1.74 0.89 0.89 -0.53 -0.53 0.01 0.09
23S 8 122 129 G:C cWW   Strong M 8.5   0.4 2.6 0.4                   0.4   87.6 234 GC,AU GC,UA,AU 3 5 2 0.5 0.78 0.93 1.71 0.93 0.97 -0.46 -0.45 0.01 0.09
23S 8 123 128 G:C cWW   Strong M 6.4 0.4 0.9 2.1   0.4   0.4                 89.3 234 GC,AU GC,CG,UA,AU 5 6 5 0.91 0.8 0.92 1.72 0.92 0.96 -0.47 -0.43 0.01 0.08
23S 9 131 148 A:U cWW   Strong M 0.4   0.4 0.4 0.4       0.4               97.9 234   GC,UA,AU 1 1 1 1.0 0.5 0.6 1.1 0.6 0.8 -0.19 -0.15 0.01 0.02
23S 9 132 147 G:C cWW   Strong M 0.4 0.4 0.9 0.4                       0.4 97.4 234   GC,CG,UA,AU 1 1 1 1.0 0.75 0.83 1.58 0.83 0.83 -0.21 -0.17 0.01 0.02
23S 9 133 146 U:A cWW   Strong M 0.4 0.4 0.9             0.4 0.4           97.4 234   GC,CG,UA 1 1 1 1.0 0.25 0.5 0.75 0.67 0.67 -0.21 -0.16 0.01 0.02
23S 9 134 145 G:C cWW   Strong M   0.9 0.4     0.4                 0.4   97.8 234   CG,UA 1 1 1 1.0 0.33 0.6 0.93 0.6 0.8 -0.21 -0.14 0.01 0.02
23S 9 135 144 U:A cWW   Strong M   0.4 0.4       0.4 0.4                 98.2 234   CG,UA,AC 1 1 1 1.0 0.33 0.5 0.83 0.5 0.5 -0.19 -0.12 0.01 0.01
23S 9 136 143 G:C cWW   Strong M 0.4       0.4                       99.1 234     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 1.0 -0.1 -0.06 0.01 0.01
23S 9 137 142 U:A cWW   Strong M                               0.4 99.6 234     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.07 -0.06 0.0 0.0
23S 10 150 176 U:A cWW   Strong M 0.4 0.4 3.0 1.3                   0.4     94.4 234 UA GC,CG,UA,AU 0 1 0 0.0 0.83 0.92 1.76 0.92 0.92 -0.29 -0.3 0.0 0.04
23S 10 151 175 C:G cWW   Strong M   2.1 0.4 3.0                 0.4       94.0 234 CG,AU CG,UA,AU 1 1 1 1.0 0.86 0.93 1.79 0.93 0.93 -0.3 -0.29 0.0 0.04
23S 10 152 174 A:U cWW   Strong M 0.4 2.6   2.1 0.4                       94.4 234 CG,AU GC,CG,AU 0 0 0 0.0 0.86 0.92 1.78 0.92 1.0 -0.28 -0.27 0.0 0.04
23S 10 153 173 U:A cWW   Strong M 0.4   0.9 3.4                         95.3 234 AU GC,UA,AU 0 0 0 0.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 -0.23 -0.23 0.0 0.04
23S 10 154 172 U:A cWW   Strong M   0.4   3.0             0.4           96.2 234 AU CG,AU 0 0 0 0.0 0.5 0.89 1.39 0.89 0.89 -0.19 -0.2 0.0 0.03
23S 10 155 171 A:U cWW   Strong M 0.4     1.3 1.7                   0.4   96.2 234   GU,UC 0 1 0 0.0 0.2 0.0 0.2 0.44 0.89 -0.21 -0.19 0.0 0.03
23S 10 156 170 A:U cWW   Strong M     0.4 0.4             2.1   0.4     0.4 96.2 234 CC UA,AU,CC 0 0 0 0.0 0.5 0.78 1.28 0.22 0.22 -0.22 -0.21 0.0 0.03
23S 10 157 169 C:G cWW   Strong M         0.4                 0.4   1.7 97.4 234   GG,UU 1 1 1 1.0 0.5 0.83 1.33 0.0 0.17 -0.16 -0.14 0.0 0.02
23S 11 183 214 C:G cWW   Strong M   10.8 1.6 0.4   0.4                   0.8 86.0 250 CG CG,UA,AU 6 3 0 0.0 0.62 0.91 1.54 0.91 0.94 -0.49 -0.52 0.0 0.11
23S 11 184 212 C:G cWW   Strong M 1.2 1.6 8.4 2.4 2.0   0.4   0.4             0.8 82.8 250 UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 10 9 6 0.63 0.59 0.79 1.38 0.79 0.91 -0.62 -0.62 0.01 0.14
23S 11 185 211 G:C cWW   Strong M 0.4 3.2 7.6 5.2       0.4 0.4               82.8 250 CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 7 7 7 1.0 0.92 0.95 1.87 0.95 0.95 -0.6 -0.63 0.01 0.14
23S 11 186 210 G:C cWW   Strong M 2.4 0.8 4.8 8.8                       0.4 82.8 250 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 10 8 8 0.89 0.95 0.98 1.93 0.98 0.98 -0.6 -0.61 0.0 0.14
23S 11 187 209 G:C cWW   Strong M 10.8 0.8 0.8 4.8                         82.8 250 GC,AU GC,CG,UA,AU 7 6 8 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 -0.6 -0.65 0.01 0.14
23S 11 188 208 G:C cWW   Strong M 1.2 4.8 8.0 1.2   2.0                     82.8 250 CG,UA,UG GC,CG,UA,AU 10 11 6 0.57 0.78 0.88 1.67 0.88 1.0 -0.63 -0.74 0.02 0.14
23S 11 194 201 G:C cWW   Strong M 16.1 1.2 2.8 69.7   0.4           0.4       2.8 6.7 254 GC,UA,AU,UU GC,CG,UA,AU 11 7 8 0.89 0.85 0.96 1.81 0.96 0.97 0.48 0.61 0.0 0.76
23S 11 195 200 A:U tSH   Strong M     3.9 87.0     1.6 0.8                 6.7 254 UA,AU UA,AU 4 5 3 0.67 0.62 0.97 1.6 0.97 0.97 1.28 1.15 0.0 0.76
23S 12 224 231 U:A cWW   Strong M   0.4 15.0 0.4     1.6           0.4       82.3 254 UA CG,UA,AU 5 1 4 1.0 0.29 0.89 1.18 0.89 0.89 -0.46 -0.44 0.01 0.14
23S 12 225 230 C:G cWW   Strong M   15.4 0.8 0.4 0.4                     0.8 82.3 254 CG CG,UA,GU 3 3 4 1.0 0.5 0.93 1.43 0.93 0.96 -0.45 -0.47 0.01 0.14
23S 12.1 234 430 U:A tWW   Strong M   3.5 9.4 0.4   0.4 1.2 0.4   0.4     0.4     0.8 83.1 254 CG,UA CG,UA,AU 3 5 1 0.25 0.53 0.79 1.32 0.79 0.81 -0.63 -0.53 0.04 0.14
23S 13 235 262 U:A cWW   Strong M   0.4 11.0 1.6 0.4   0.4     1.2   0.4 1.6     2.8 80.4 254 UA,UU CG,UA,AU 16 6 5 0.46 0.23 0.66 0.89 0.66 0.68 -0.74 -0.55 0.28 0.16
23S 13 236 261 C:G cWW   Strong M 2.4 7.9 9.4 28.7 4.3   5.9 1.6 0.4 2.4 0.8 2.0     2.0 6.3 26.1 254 GC,CG,UA,AU,GU,AA,CA,CU,UC,UU GC,CG,UA,AU 27 26 12 0.45 0.43 0.65 1.09 0.65 0.71 -0.27 -0.49 0.08 0.6
23S 13 237 260 C:G cWW   Strong M 1.2 25.6 17.7 10.6   2.4 1.6 0.4 3.1 2.0 0.4 3.1 0.8   3.5 13.4 14.3 254 CG,UA,AU,UG,AG,CA,CU,UC,UU GC,CG,UA,AU 25 24 9 0.37 0.49 0.64 1.13 0.64 0.67 -0.18 -0.37 0.01 0.7
23S 13 238 259 C:G cWW   Strong M 8.7 29.5 10.6 14.6 1.2   0.4 1.2   0.8 1.2 2.8 0.4   2.4 15.0 11.5 254 GC,CG,UA,AU,CU,UC,UU GC,CG,AA,UU 29 20 11 0.45 0.41 0.6 1.01 0.72 0.73 -0.29 -0.37 0.02 0.72
23S 13 245 253 G:C cWW   Strong M 13.4 10.2 55.1 8.3 0.8 0.4 0.8 1.2   1.6 0.4   0.4     1.6 5.9 254 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 13 15 10 0.71 0.82 0.93 1.74 0.93 0.94 0.07 0.09 0.0 0.77
23S 13 246 252 C:G cWW   Strong M 19.7 5.9 11.8 46.1   7.5 0.4     0.4   0.4 0.4     1.6 5.9 254 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 16 15 10 0.65 0.78 0.89 1.67 0.89 0.97 -0.07 -0.1 0.0 0.77
23S 14 265 427 A:U tSS   Strong M 0.8   1.6 12.2 0.8   0.4                   84.3 254 AU GC,UA,AU 6 5 4 0.73 0.67 0.93 1.59 0.93 0.97 -0.46 -0.45 0.01 0.13
23S 14 266 426 G:C cWW   Strong M 12.6   0.4 2.4                       0.4 84.3 254 GC,AU GC,UA,AU 6 6 6 1.0 0.88 0.97 1.85 0.97 0.97 -0.47 -0.45 0.01 0.13
23S 14 267 425 C:G cWW   Strong M 6.3 5.1 2.8 0.4     0.4       0.4   0.4       84.3 254 GC,CG,UA GC,CG,UA,AU 9 8 7 0.82 0.88 0.93 1.8 0.93 0.93 -0.58 -0.59 0.0 0.13
23S 14 268 424 C:G cWW   Strong M 0.4 8.7 3.5 0.4   0.4 0.4             1.2   0.8 84.3 254 CG,UA GC,CG,UA,AU 9 8 7 0.82 0.61 0.82 1.44 0.82 0.85 -0.56 -0.54 0.0 0.13
23S 16 271 366 G:C cWW   Strong M 1.6     0.4                 0.4       97.7 254   GC,AU 0 1 0 0.0 0.5 0.83 1.33 0.83 0.83 -0.22 -0.22 0.0 0.02
23S 16 272 365 A:U cWW   Strong M   0.4     0.4   0.4 0.4               1.2 97.3 254   CG,AA,UU 1 1 0 0.0 0.5 0.71 1.21 0.14 0.29 -0.23 -0.27 0.01 0.02
23S 16 273 364 G:C cWW   Strong M     0.4 0.4 1.2 0.4             0.4     0.4 96.9 254   UA,GU 1 1 0 0.0 0.2 0.0 0.2 0.25 0.75 -0.23 -0.28 0.01 0.03
23S 18 282 358 A:U cWW   Strong M     0.4 1.2 0.4   0.4 1.6 0.4     0.8       0.4 94.5 254   UA,AC,CU 3 2 1 0.4 0.3 0.5 0.8 0.29 0.36 -0.33 -0.35 0.0 0.04
23S 18 283 357 G:C cWW   Strong M       1.6 1.6   0.8   0.8   0.4 0.4       0.8 93.7 254   AU,CC 2 3 1 0.4 0.08 0.0 0.08 0.25 0.5 -0.37 -0.35 0.0 0.05
23S 18 290 350 U:G cWW   Strong M 2.0   0.8 2.0 0.4   0.4   0.4 0.4     0.4     0.4 93.0 254 GC,AU GC,UA,AU 3 4 2 0.57 0.54 0.67 1.21 0.67 0.72 -0.41 -0.38 0.01 0.06
23S 18 291 349 G:U cWW   Strong M 1.2 0.4 1.2 2.0 0.8   0.4   0.4 0.4     0.4   0.4   92.6 254 AU GC,CG,UA,AU 5 5 3 0.6 0.5 0.63 1.13 0.63 0.74 -0.43 -0.4 0.01 0.06
23S 18 292 348 U:A cWW   Strong M   0.8 1.6 1.6   0.4 0.4   0.4         0.4   1.6 93.0 254   CG,UA,AU 5 3 2 0.5 0.43 0.56 0.98 0.56 0.61 -0.43 -0.36 0.02 0.06

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CSV options: 

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select f.molecule, f.helix_number, f.position_1, f.position_2,
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from basepair_frequency f
left join basepair_collective_score s
  on s.molecule = f.molecule and s.position_1 = f.position_1
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