Base-pair statistics (frequencies and scores together) (view)

predominant_types
Base-pair types shown in bold in the published table (most frequent).
covarying_types
Base-pair types marked * in the published table (involved in a covariation).
sequences
Number of sequences in the group.

86 rows where group_code = "E" and tertiary_type = "3°: base pair" sorted by position_1

✎ View and edit SQL

This data as json, CSV (advanced)

Suggested facets: reference_base_pair, GU, UG, AA, AC, AG, CA, CU, GA, GG, UC, UU, gap, covarying_types, Xch, Ych, PE, PES, Cov3, WC, WCGU, DfDel

conformation 7

strength 5

molecule 3

tertiary_type 1

  • 3°: base pair · 86 ✖

group_code 1

molecule helix_number position_1 ▼ position_2 reference_base_pair conformation tertiary_type strength group_code GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap sequences predominant_types covarying_types Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1_C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc
23S 2 30 510 G:C cWW 3°: base pair Strong E 30.8 44.4 1.7 17.1   4.3                     1.8 117 GC,CG,AU,UG GC,CG,UA,AU 7 8 5 0.67 0.92 0.96 1.88 0.96 1.0 0.15 0.41 0.01 0.44
16S 5 47 361 C:G cWW 3°: base pair Strong E 97.6   1.7 0.1       0.1         0.1   0.1   0.2 936 GC GC,UA,AU 2 2 2 1.0 0.85 1.0 1.85 1.0 1.0 1.83 1.85 0.0 0.89
23S 5 53 117 A:G tHS 3°: base pair Significant E       1.7         96.6         0.9     0.9 117 AG   1 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 1.84 1.79 0.0 0.44
16S 6 68 101 G:A cWW 3°: base pair Weak E   1.5 93.1 2.6   0.3 0.2   0.2 0.2   0.1 0.2 0.1   1.3 0.1 973 UA,AU CG,UA,AU 8 6 3 0.43 0.61 0.97 1.58 0.97 0.98 1.63 1.6 0.0 0.92
5S 3 75 101     3°: base pair Strong E       57.7     2.7 20.8 18.8                 298 AU,AA,AC,AG                            
5S 3 76 100     3°: base pair Strong E                         99.7 0.3       298 GA                            
5S 3 77 99     3°: base pair Strong E     99.7     0.3                       298 UA                            
5S 3 78 98     3°: base pair Significant E                 100.0                 298 AG                            
16S 7 129 232 A:G cWW 3°: base pair Strong E 0.1 0.8 72.3   0.1 25.7 0.1   0.4       0.1 0.1   0.2 0.1 1015 UA,UG CG,UA,GU 6 17 3 0.26 0.03 0.0 0.03 0.73 0.99 1.84 1.12 0.0 0.96
16S 8 145 177 G:G cWW 3°: base pair Strong E 0.3 0.3 0.1 24.8 1.2   1.3 0.9 0.2 0.1   2.0     0.1 64.6 4.3 1018 AU,CU,UU GC,CG,AA,UU 28 7 4 0.23 0.06 0.0 0.06 0.27 0.28 0.74 1.45 0.03 0.93
16S 8 152 169 A:C tHW 3°: base pair Strong E 0.4     0.1   0.2 1.3 83.6 1.0 0.6 9.8   0.9   1.4 0.2 0.6 1021 AC,CC UG,AC,GA 16 6 0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.01 0.01 1.26 1.66 0.0 0.96
16S 11 245 283 U:U cWW 3°: base pair Strong E               0.1   0.1 99.2         0.6   1024 CC CC,UU 3 4 3 0.86 0.75 1.0 1.75 0.0 0.0 1.94 1.94 0.0 0.97
23S 19.2 319 323 G:C cWW 3°: base pair Strong E 1.4 88.7 1.8 0.5   5.0 0.5   0.5               1.9 221 CG,UG GC,CG,UA,AU 7 3 3 0.6 0.38 0.94 1.32 0.94 0.99 1.31 1.61 0.0 0.82
16S 13 321 332 A:G cWW 3°: base pair Strong E   99.7               0.2       0.1       1025 CG   2 2 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.99 1.98 0.0 0.97
16S 15 367 393 U:A cWW 3°: base pair Strong E 0.1 0.1 98.0     1.8                       1017 UA GC,CG,UA 1 3 1 0.5 0.1 0.0 0.1 0.98 1.0 1.98 1.85 0.0 0.96
23S 21 383 391 C:A cWW 3°: base pair ??? E     0.5                           99.6 221     0 10 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 -0.03 0.46 0.84 0.0
16S 17 438 496 U:A tWH 3°: base pair Strong E                                 100.0 1030     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.04 0.0 0.0
16S 17 440 497 C:G cWW 3°: base pair Strong E                                 100.0 1030     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.05 0.0 0.0
16S 17 441 493 A:A cWW 3°: base pair Strong E                                 100.0 1030     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.04 0.0 0.0
16S 17 450 483 G:C cWW 3°: base pair Strong E                                 100.0 1030     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
23S 24.1 531 2018 C:G cWW 3°: base pair Strong E 0.7           93.3     1.3     3.3       1.3 150 AA,GA GC,AA 6 1 1 0.29 0.12 0.0 0.12 0.01 0.01 1.29 1.94 0.01 0.56
23S 25 537 556 G:A cWW 3°: base pair Strong E 8.7 1.4 67.8 9.1 0.5   1.4   1.0     0.5   0.5   1.9 7.3 208 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 11 7 6 0.67 0.77 0.94 1.71 0.94 0.94 0.52 0.53 0.01 0.73
23S 25 538 555 A:G cWW 3°: base pair Weak E 38.2 2.4   9.2 20.8 13.0               0.5   5.8 10.1 207 GC,CG,AU,GU,UG,UU GC,AU,UG 11 11 2 0.18 0.43 0.67 1.1 0.55 0.93 0.13 0.14 0.02 0.71
23S 25.1 563 578 A:G cWW 3°: base pair Strong E   95.2 1.9     2.4                     0.5 207 CG,UG CG,UA 2 2 1 0.5 0.44 0.98 1.42 0.98 1.0 1.74 1.81 0.0 0.78
23S 25.1 565 576 C:U cWW 3°: base pair Strong E 98.6             1.4                   207 GC   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.89 2.0 0.0 0.79
16S 19.1 575 880 G:C cWW 3°: base pair Strong E 0.6   0.1 96.0 3.0   0.1 0.1 0.1                 1005 AU,GU GC,UA,AU 5 4 3 0.67 0.17 0.0 0.17 0.97 1.0 1.77 1.91 0.0 0.95
16S 20 582 758 C:C No BP 3°: base pair Strong E 0.3   0.9     1.2   0.2             97.4   0.1 1032 UC   2 4 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 1.95 1.82 0.0 0.98
16S 21 611 629 C:A cWW 3°: base pair Strong E                                 100.0 1042     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
23S 31 637 651 A:G cWW 3°: base pair Strong E                                 100.0 203     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.04 0.0 0.0
16S 22 663 742 A:G cWW 3°: base pair Strong E   33.9 15.5 0.1   49.5   0.3         0.1 0.2 0.3   0.2 1029 CG,UA,UG UG,AC,GA 20 8 4 0.29 0.01 0.0 0.01 0.5 0.99 0.99 1.32 0.0 0.97
16S 23 674 716 G:A cWW 3°: base pair Strong E 93.1 0.5   4.7 0.4 0.5             0.4 0.2     0.3 1026 GC,AU GC,CG,AU 7 13 7 0.7 0.78 0.98 1.76 0.98 0.99 1.64 1.55 0.0 0.97
23S 32 674 806 G:C cWW 3°: base pair ??? E 99.5       0.5                         202 GC   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 1.0 2.0 1.96 0.0 0.77
23S 33 698 763 C:G cWW 3°: base pair Strong E 2.0 45.4 43.4 1.0   2.0       2.9 1.0 1.0 0.5 1.0       205 GC,CG,UA,UG,CA GC,CG,UA,AU 8 9 4 0.47 0.85 0.92 1.76 0.92 0.94 0.75 0.72 0.0 0.78
23S 34 713 718 G:A cWW 3°: base pair Strong E 85.3 10.3 1.5 2.5       0.5                   204 GC,CG,AU GC,CG,UA,AU 7 8 6 0.8 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 1.23 1.25 0.0 0.78
16S 23.1 722 733 G:G tWW 3°: base pair Strong E 0.1 0.1 12.2 0.3 3.3 0.1 56.2 0.2 0.7       5.9 20.6     0.3 1033 UA,GU,AA,GA,GG AA,GG 16 11 3 0.22 0.47 0.77 1.25 0.13 0.16 0.64 0.98 0.0 0.98
23S 38 847 933 U:A cWW 3°: base pair Strong E 0.9 15.2 1.4 9.0   2.8 0.5   0.9         2.8     66.4 211 CG,AU,UG,GG GC,CG,UA,AU 2 15 1 0.12 0.61 0.79 1.4 0.79 0.87 -0.84 0.52 0.53 0.27
23S 38 857 920 G:A cWW 3°: base pair Strong E   27.4 9.0 5.2 0.9 12.7 15.1 0.5 13.7   0.5   12.3     1.4 1.5 212 CG,UA,AU,UG,AA,AG,GA CG,AA,UU 14 12 4 0.31 0.23 0.45 0.68 0.42 0.56 0.0 0.56 0.0 0.8
16S 30 945 1236 G:A cWW 3°: base pair Strong E 0.1       0.1   0.1     0.2     98.9 0.1     0.5 976 GA   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.9 1.97 0.01 0.92
16S 33.2 1026 1035 G:A cWW 3°: base pair Strong E                                 100.0 1029     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
23S 42 1032 1122 A:G cWW 3°: base pair Strong E 92.9 0.5   3.0   2.0             1.0       0.5 197 GC,AU,UG GC,AU,UG 5 5 4 0.8 0.77 0.98 1.75 0.97 0.99 1.54 1.5 0.0 0.74
23S 42 1039 1116 A:G cWW 3°: base pair Strong E   3.4 95.1     0.5                 0.5   0.5 203 CG,UA CG,UA 3 3 3 1.0 0.78 0.99 1.77 0.99 0.99 1.6 1.66 0.0 0.77
23S 42 1040 1115 A:G cWW 3°: base pair Strong E 9.8 2.4 66.8 2.0   2.9       15.6             0.5 205 GC,CG,UA,AU,UG,CA GC,CG,UA,AU 7 6 5 0.77 0.43 0.81 1.25 0.81 0.84 0.72 1.06 0.0 0.78
16S 34 1061 1195 G:C cWW 3°: base pair No Support E 99.3       0.2           0.2     0.1     0.2 998 GC   0 3 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 1.0 1.97 1.96 0.0 0.94
16S 34 1062 1194 U:U cWW 3°: base pair Strong E   2.6 96.2   0.1 0.5             0.2     0.2 0.2 998 CG,UA CG,UA,GU 3 6 3 0.67 0.75 0.99 1.74 0.99 1.0 1.77 1.76 0.0 0.94
23S 43.1 1082 1086 U:A tWW 3°: base pair Strong E   98.6       0.5                     1.0 211 CG   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 1.0 1.86 1.95 0.0 0.8
23S 44 1087 1102 G:C cWW 3°: base pair Strong E 95.6     3.4 0.5                       0.5 206 GC,AU GC,AU 3 3 3 1.0 0.88 0.99 1.87 0.99 1.0 1.74 1.71 0.0 0.78
23S 46 1196 1250 C:G cWW 3°: base pair Strong E 0.5 84.9 9.7   0.5 1.6 0.5   0.5         1.1     0.5 185 CG,UA GC,CG,UA 4 3 1 0.29 0.7 0.96 1.66 0.96 0.98 1.19 1.37 0.0 0.7
23S 46 1203 1242 U:U cWW 3°: base pair Strong E 71.2 2.1 2.6 19.9 1.0                   0.5 2.1 0.5 191 GC,CG,UA,AU,UU GC,CG,UA,AU 13 13 9 0.69 0.87 0.96 1.83 0.96 0.97 0.83 0.86 0.0 0.72
23S 46 1204 1241 A:A cWW 3°: base pair Strong E 1.6 4.7 14.1 0.5   70.8     0.5           0.5 5.7 1.5 192 CG,UA,UG,UU GC,AU,UG 1 14 3 0.4 0.07 0.0 0.07 0.21 0.93 1.44 0.85 0.0 0.72
23S 46.1 1263 2016 U:U cWW 3°: base pair Strong E 100.0                                 150 GC   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.94 2.0 0.0 0.57
16S 42 1303 1334 C:G cWW 3°: base pair Strong E 98.6   0.5 0.3       0.2           0.3     0.1 1021 GC GC,UA,AU 5 5 5 1.0 0.61 0.99 1.61 0.99 0.99 1.9 1.9 0.0 0.97
16S 42 1307 1330 U:U cWW 3°: base pair Strong E         0.1       0.3   3.1       0.7 95.6 0.2 1022 CC,UU AG,CC,UU 5 4 4 0.89 0.81 0.99 1.81 0.0 0.0 1.74 1.73 0.0 0.97
23S 51 1348 1598 C:A cWW 3°: base pair Significant E     3.7       2.4                   93.9 164 UA,AA   1 11 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.6 -0.3 0.74 0.63 0.04
16S 43 1357 1365 A:G cWW 3°: base pair Strong E 84.4 0.9 4.7 3.5 0.1 3.1     0.2 1.6       1.1 0.1   0.4 1023 GC,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 11 11 7 0.64 0.6 0.94 1.53 0.94 0.97 1.19 1.12 0.0 0.97
23S 52 1359 1372 A:U cWW 3°: base pair Strong E                                 100.0 181     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
16S 44 1399 1504 C:G cWW 3°: base pair Strong E   99.0       0.1       0.2   0.1   0.1     0.3 837 CG   2 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.95 1.95 0.0 0.79
16S 44 1402 1500 C:A cWW 3°: base pair Strong E     0.2     0.1       99.4   0.1         0.1 861 CA UG,CA 2 2 1 0.5 0.25 1.0 1.25 0.0 0.0 1.96 1.96 0.0 0.82
16S 44 1407 1494 C:G cWW 3°: base pair ??? E   99.2       0.3         0.1 0.1         0.2 883 CG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 1.0 1.96 1.96 0.0 0.84
16S 44 1413 1487 A:G cWW 3°: base pair Strong E   5.5 92.7 0.4   0.1   0.1             1.0   0.1 908 CG,UA CG,UA,AU 6 6 5 0.83 0.83 0.99 1.82 0.99 0.99 1.67 1.55 0.0 0.86
23S 55 1425 1573 G:G cWW 3°: base pair Strong E 2.8 10.6 12.3 70.4   2.8 0.6                   0.6 179 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 7 9 5 0.62 0.89 0.97 1.85 0.97 0.99 0.69 0.68 0.0 0.68
23S 59 1527 1544 G:A No BP 3°: base pair Strong E 2.8 67.8 4.4 0.6 15.6       0.6         0.6     7.8 180 GC,CG,UA,GU CG,UA,GU 6 6 5 0.83 0.82 0.95 1.77 0.82 0.99 0.46 0.57 0.01 0.63
23S 59 1528 1543 A:G tHS 3°: base pair Strong E 17.2 18.9 2.2 51.7 0.6 0.6     1.1               7.8 180 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 6 9 6 0.8 0.94 0.98 1.92 0.98 0.99 0.05 0.14 0.01 0.63
23S 62 1690 1697 A:G tHS 3°: base pair Strong E         0.6   4.5   93.5 0.6   0.6           155 AA,AG GU,AG,CA 2 4 1 0.33 0.2 0.0 0.2 0.0 0.01 1.84 1.61 0.0 0.59
23S 63.1 1752 1756 C:G cWW 3°: base pair Strong E 88.5 0.6 3.2   2.6           0.6     0.6 2.6   1.2 156 GC,UA,GU,UC GC,CG,UA 2 3 0 0.0 0.38 0.94 1.31 0.94 0.96 1.52 1.4 0.0 0.59
23S 66 1800 1817 C:G tWW 3°: base pair Strong E   1.3 5.8 87.1 0.6 0.6 1.3 1.3 0.6               1.3 155 UA,AU CG,UA,AU 1 5 2 0.67 0.61 0.95 1.56 0.95 0.97 1.5 1.24 0.01 0.58
23S 66 1803 1814 A:G tHS 3°: base pair Weak E 2.6 1.9 0.6 1.9 89.1     0.6                 3.2 156 GC,GU CG,UA,GU,AC 4 5 1 0.22 0.42 0.95 1.37 0.07 0.99 1.37 1.3 0.0 0.57
23S 68 1855 1887 U:C cWW 3°: base pair Strong E                                 100.0 155     0 8 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.59 0.0
23S 68 1856 1886 U:U cWW 3°: base pair Strong E                                 100.0 155     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
23S 68 1858 1884 A:G tHS/tSH 3°: base pair Strong E                                 100.0 155     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
23S 68 1859 1883 U:U cWW 3°: base pair Strong E                                 99.9 155     9 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.57 0.0
23S 69.1 1925 1929 C:G tWW 3°: base pair Strong E           99.4                     0.6 155 UG   0 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.93 1.94 0.0 0.59
23S 75 2086 2233 U:U cWW 3°: base pair Strong E   3.2 53.5 2.6           38.7     0.6     0.6 0.6 155 CG,UA,AU,CA CG,UA,AU 10 4 3 0.43 0.13 0.0 0.13 0.6 0.6 0.75 1.59 0.0 0.59
23S 76 2104 2185 C:U cWW 3°: base pair Strong E   5.2 85.2 2.6 1.3 3.9   0.6               1.3   155 CG,UA,AU,UG CG,UA,AU 4 6 1 0.2 0.52 0.93 1.45 0.93 0.98 1.41 1.22 0.0 0.59
23S 76 2109 2180 U:U cWW 3°: base pair Weak E 96.1     0.6   2.6                     0.6 155 GC,UG GC,AU,UG 1 1 1 1.0 1.0 1.0 2.0 0.97 1.0 1.7 1.77 0.0 0.59
23S 81.1 2282 2427 G:C cWW 3°: base pair Strong E 94.8 2.6     2.6                         155 GC,CG,GU GC,CG 1 2 0 0.0 0.5 0.97 1.47 0.97 1.0 1.83 1.59 0.0 0.59
23S 86 2351 2366 G:A cWW 3°: base pair Weak E 16.1 3.9 3.9 2.6 1.9 1.3             70.3         155 GC,CG,UA,AU,GA CG,AU,GA 5 8 4 0.61 0.22 0.77 0.98 0.27 0.3 1.3 0.83 0.0 0.59
23S 86 2352 2365 A:G cWW 3°: base pair Strong E 3.9   4.5 91.0               0.6           155 GC,UA,AU GC,UA,AU 5 4 4 0.89 0.93 0.99 1.92 0.99 0.99 1.45 1.5 0.0 0.59
23S 90 2507 2582 C:G cWW 3°: base pair Strong E   100.0                               135 CG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.51
23S 90 2512 2574 C:G cWW 3°: base pair Strong E   97.8               2.2               135 CG,CA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.98 2.0 1.85 0.0 0.51
23S 96 2675 2732 A:G cWW 3°: base pair Strong E   2.2 4.3 1.4 2.9 1.4   1.4       1.4 0.7 2.2 33.3 47.8 0.7 138 CG,UA,GU,GG,UC,UU CG,AC,GA,UU 4 8 1 0.17 0.09 0.0 0.09 0.08 0.12 1.28 0.47 0.0 0.52
23S 99 2808 2891 G:U No BP 3°: base pair ??? E   7.1   2.4 1.2 9.5     4.8       4.8     2.4 67.9 84 CG,AU,UG,AG,GA,UU AU,UG,GA 2 5 1 0.29 0.32 0.52 0.83 0.3 0.63 -0.85 0.46 0.26 0.1
23S 99 2813 2887 A:A cWW 3°: base pair Strong E 2.4 21.2 60.0 1.2 1.2             1.2 1.2 1.2   4.7 6.0 85 GC,CG,UA,UU GC,CG,UA,AU 5 8 4 0.61 0.72 0.9 1.62 0.9 0.91 0.76 0.48 0.0 0.3
23S 99 2814 2886 A:A cWW 3°: base pair Strong E 3.5 72.9 1.2 3.5     5.9     1.2 4.7 2.4       1.2 3.6 85 GC,CG,AU,AA,CC,CU GC,CG,AA,UU 7 7 6 0.86 0.45 0.87 1.32 0.84 0.84 1.02 0.6 0.0 0.31
23S 101 2844 2872 G:A cWW 3°: base pair Strong E 1.1   4.5 1.1 2.2 1.1         3.4       1.1 77.5 7.9 89 UA,GU,CC,UU CC,UU 4 3 1 0.29 0.23 0.88 1.11 0.07 0.11 1.1 0.88 0.0 0.31
23S 101 2845 2871 U:U cWW 3°: base pair No Support E 22.7 3.4   52.3 3.4 11.4       1.1   1.1   1.1   2.3 1.1 88 GC,CG,AU,GU,UG,UU GC,AU,UG,CA 6 7 3 0.46 0.76 0.89 1.64 0.79 0.94 0.32 0.58 0.01 0.33
23S 101 2849 2866 U:U No BP 3°: base pair Strong E           1.8       0.9   0.9   0.9 0.9 87.2 7.4 109 UU CA,GG,UU 4 0 0 0.0 0.33 0.96 1.29 0.0 0.02 1.34 1.06 0.03 0.38

Advanced export

JSON shape: default, array, newline-delimited

CSV options: 

CREATE VIEW basepair_combined as
select f.molecule, f.helix_number, f.position_1, f.position_2,
       f.reference_base_pair, f.conformation, f.tertiary_type, f.strength, f.group_code,
       f.GC, f.CG, f.UA, f.AU, f.GU, f.UG, f.AA, f.AC, f.AG, f.CA, f.CC, f.CU, f.GA, f.GG, f.UC, f.UU, f.gap, f.Seq as sequences,
       f.predominant_types, f.covarying_types,
       s.Xch, s.Ych, s.PE, s.PES, s.Cov1, s.Cov3, s."C1+C3" as C1_C3,
       s.WC, s.WCGU, s.XCons, s.YCons, s.DfDel, s.PNuc
from basepair_frequency f
left join basepair_collective_score s
  on s.molecule = f.molecule and s.position_1 = f.position_1
 and s.position_2 = f.position_2 and s.group_code = f.group_code;