Base-pair statistics (frequencies and scores together) (view)

predominant_types
Base-pair types shown in bold in the published table (most frequent).
covarying_types
Base-pair types marked * in the published table (involved in a covariation).
sequences
Number of sequences in the group.

478 rows where group_code = "C" and molecule = "16S" sorted by position_1

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Suggested facets: reference_base_pair, AA, AC, AG, CA, CC, CU, GA, GG, UC, UU, Xch, Ych, PE, DfDel

conformation 8

strength 4

tertiary_type 2

molecule 1

  • 16S · 478 ✖

group_code 1

molecule helix_number position_1 ▼ position_2 reference_base_pair conformation tertiary_type strength group_code GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap sequences predominant_types covarying_types Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1_C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc
16S 1 9 25 G:C cWW   Strong C 97.6             1.6     0.8             123 GC   2 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.98 1.81 2.0 0.0 0.68
16S 1 10 24 A:U cWW   Strong C       100.0                           124 AU   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.68
16S 1 11 23 G:C cWW   Strong C 99.2             0.8                   125 GC   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.93 2.0 0.0 0.69
16S 1 12 22 U:G cWW   Strong C           99.2               0.8       126 UG   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 1.93 2.0 0.0 0.69
16S 1 13 21 U:G No BP   Weak C     0.8     94.4                   4.8   126 UG,UU   0 2 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.95 2.0 1.66 0.0 0.69
16S 2 17 918 U:A cWW 3°: pseudoknot Strong C     100.0                             117 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 1.93 0.01 0.64
16S 2 18 917 C:G cWW 3°: pseudoknot Strong C   99.2             0.8                 118 CG   1 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.94 1.93 0.01 0.65
16S 2 19 916 A:U cWW 3°: pseudoknot Strong C   91.5             8.5                 117 CG,AG   5 2 1 0.29 0.0 0.0 0.0 0.92 0.92 1.4 1.93 0.0 0.64
16S 3 27 556 G:C cWW   Strong C 97.7     1.5 0.8                         132 GC GC,AU 0 1 0 0.0 0.67 0.99 1.66 0.99 1.0 1.89 1.87 0.0 0.72
16S 3 28 555 A:U cWW   Strong C 94.0     3.8 1.5     0.8                   133 GC,AU GC,AU 5 6 2 0.36 0.62 0.98 1.6 0.98 0.99 1.68 1.61 0.0 0.73
16S 3 29 554 U:A cWW   Strong C 1.5     93.3 3.7                     1.5   134 AU,GU GC,AU 3 1 1 0.5 0.22 0.95 1.17 0.95 0.98 1.61 1.91 0.0 0.74
16S 3 30 553 U:A cWW   Strong C   2.2 92.5 1.5   0.7             3.0         134 CG,UA,GA CG,UA,AU 4 3 1 0.29 0.5 0.96 1.46 0.96 0.97 1.49 1.68 0.0 0.74
16S 3 32 552 A:U cWW   Strong C       100.0                           135 AU   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.74
16S 3 33 551 A:U cWW   Strong C     1.5 97.8               0.7           135 AU UA,AU 1 0 0 0.0 0.67 0.99 1.66 0.99 0.99 1.83 1.91 0.0 0.74
16S 3 34 550 C:G cWW   Strong C   98.5       0.7       0.7               136 CG   1 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.99 1.94 1.95 0.0 0.75
16S 3 35 549 G:C cWW   Weak C 86.8       13.2                         136 GC,GU   0 6 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 1.0 2.0 1.43 0.0 0.75
16S 3 36 548 C:G cWW   Strong C   99.3                       0.7       152 CG   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.95 2.0 0.0 0.83
16S 3 37 547 U:A tWS   Weak C     96.7       1.3     0.7     0.7       0.7 152 UA   3 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.97 1.79 1.94 0.01 0.83
16S 4 39 403 G:C cWW   Weak C 98.1     0.6 0.6                   0.6     154 GC GC,AU 1 3 1 0.5 0.33 0.99 1.32 0.99 0.99 1.89 1.81 0.0 0.85
16S 4 40 402 C:G cWW   Strong C   96.1 1.3 0.6     1.3   0.6                 155 CG CG,UA,AU 3 5 2 0.5 0.33 0.97 1.31 0.98 0.98 1.73 1.74 0.0 0.85
16S 4 41 401 G:C cWW   Strong C 92.9     4.5 0.6     0.6             1.3     154 GC,AU GC,AU 5 5 4 0.8 0.64 0.97 1.61 0.97 0.98 1.61 1.67 0.0 0.85
16S 4 42 400 G:C cWW   Strong C 94.8     3.2 0.6     0.6               0.6   155 GC,AU GC,AU 3 4 2 0.57 0.62 0.98 1.61 0.98 0.99 1.71 1.7 0.0 0.85
16S 4 43 399 C:G cWW   Strong C   58.3 39.1 0.6   0.6       0.6       0.6       156 CG,UA CG,UA,AU 9 9 7 0.78 0.95 0.98 1.94 0.98 0.99 0.93 0.98 0.0 0.86
16S 4 44 398 A:U cWW   Strong C 7.1     91.0       0.6       0.6       0.6   156 GC,AU GC,AU 5 4 2 0.44 0.79 0.98 1.77 0.98 0.98 1.53 1.58 0.0 0.86
16S 4 45 396 G:C cWW   Strong C 0.6   93.6     5.8                       156 UA,UG GC,UA 2 5 2 0.57 0.1 0.0 0.1 0.94 1.0 1.95 1.62 0.0 0.86
16S 4 46 395 G:C cWW   Strong C 97.4     1.9                   0.6       156 GC GC,AU 2 4 2 0.67 0.75 0.99 1.74 0.99 0.99 1.86 1.78 0.0 0.86
16S 5 47 361 C:G cWW 3°: base pair Strong C   96.8               0.6 1.3     0.6     0.6 156 CG   1 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.97 1.88 1.85 0.01 0.85
16S 5 52 359 C:G cWW   Strong C   96.2 2.6             0.6             0.6 156 CG,UA CG,UA 2 3 2 0.8 0.8 0.99 1.79 0.99 0.99 1.83 1.74 0.01 0.85
16S 5 53 358 A:U cWW   Strong C       100.0                           158 AU   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.87
16S 5 54 357 C:G cWW   Weak C   100.0                               158 CG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.87
16S 5 56 356 U:A cWW   Weak C     100.0                             158 UA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.87
16S 5 57 355 G:C cWW   Strong C 99.4             0.6                   157 GC   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.95 2.0 0.0 0.86
16S 5 58 354 C:G cWW   Weak C   100.0                               158 CG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.87
16S 6 61 106 G:C cWW   Strong C 97.5     2.5                           162 GC,AU GC,AU 1 1 1 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.83 1.84 0.0 0.89
16S 6 62 105 U:G cWW   Weak C           99.4                     0.6 162 UG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 2.0 1.94 0.01 0.89
16S 6 63 104 C:G cWW   Strong C   85.8 6.8     6.8           0.6           162 CG,UA,UG CG,UA 9 8 4 0.47 0.48 0.93 1.4 0.93 0.99 1.43 1.6 0.0 0.89
16S 6 66 103 A:U cWW   Strong C       100.0                           163 AU   1 1 1 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.9
16S 6 67 102 C:G cWW   Strong C   95.7 1.8 0.6             1.2         0.6   163 CG CG,UA,AU 2 4 1 0.33 0.57 0.98 1.55 0.98 0.98 1.78 1.69 0.0 0.9
16S 6 68 101 G:A cWW 3°: base pair Weak C 1.8   2.4 0.6 0.6               92.7 1.8       164 UA,GA AU,GA 4 5 1 0.22 0.08 0.0 0.08 0.05 0.06 1.78 1.65 0.0 0.9
16S 6 69 99 G:C cWW   Strong C 31.7 1.8 1.2 28.0 11.6   4.9 7.9 5.5   1.8   2.4 0.6   1.8 0.6 164 GC,AU,GU,AA,AC,AG,GA GC,CG,UA,AU 20 20 5 0.25 0.46 0.63 1.09 0.63 0.75 0.59 0.31 0.0 0.9
16S 6 70 98 U:A cWW   Strong C 34.4   3.1 36.2 13.5 1.2   1.8     0.6   2.5 1.8   2.5 2.4 163 GC,UA,AU,GU,GA,UU GC,UA,AU 18 18 7 0.39 0.61 0.76 1.36 0.76 0.91 0.52 0.41 0.01 0.87
16S 6 73 97 C:G cWW   Strong C   0.6 3.0 1.8 1.2   1.2           0.6   0.6 3.0 87.8 164 UA,UU CG,UA,AU 2 2 0 0.0 0.27 0.45 0.72 0.45 0.55 -0.51 -0.49 0.02 0.11
16S 6 74 96 A:U cWW   Strong C     2.4 1.2 0.6   1.8           1.2 2.4   3.0 87.2 164 UA,GG,UU AA,GG,UU 4 1 0 0.0 0.44 0.57 1.01 0.29 0.33 -0.53 -0.52 0.02 0.12
16S 6 75 95 G:C cWW   Strong C   0.6 4.3 3.0 0.6   1.2       1.8 0.6     0.6 1.2 85.9 164 UA,AU UA,AU,CC 4 3 0 0.0 0.5 0.65 1.15 0.56 0.61 -0.65 -0.57 0.06 0.13
16S 6 76 93 G:U cWW   Strong C 1.2 4.3 7.9 14.6 0.6 1.8   0.6 3.0             0.6 65.2 164 CG,UA,AU,AG GC,CG,UA,AU 9 9 5 0.56 0.67 0.81 1.47 0.81 0.88 -0.8 -0.83 0.03 0.31
16S 6 77 92 A:U cWW   Strong C 0.6 1.8 12.8 17.7 2.4       1.2         0.6     62.8 164 UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 9 9 6 0.67 0.78 0.89 1.67 0.89 0.95 -0.8 -0.74 0.03 0.34
16S 6 78 91 A:U cWW   Strong C 3.0 1.8 17.6 5.5 9.1 1.2 0.6   0.6     0.6     0.6   59.4 165 GC,UA,AU,GU CG,UA,GU 7 8 4 0.53 0.47 0.7 1.18 0.69 0.94 -0.85 -0.84 0.02 0.37
16S 6 79 90 G:C cWW   Strong C 3.6 10.3 7.9 30.9 2.4 3.0 0.6     0.6     0.6 0.6     39.4 165 GC,CG,UA,AU,GU,UG GC,CG,UA,AU 15 14 7 0.48 0.73 0.87 1.6 0.87 0.96 -0.81 -0.69 0.02 0.55
16S 6 80 89 A:U cWW   Strong C 18.2 8.5 12.7 50.3 0.6 1.2   1.8             0.6 0.6 5.5 165 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 17 18 16 0.91 0.89 0.95 1.84 0.95 0.97 0.0 -0.08 0.02 0.86
16S 6 81 88 A:U cWW   Strong C 9.1 9.1 33.3 23.6 13.9 7.3             1.8       1.8 165 GC,CG,UA,AU,GU,UG GC,CG,UA,AU 20 17 9 0.49 0.65 0.77 1.41 0.77 0.98 0.03 0.04 0.0 0.89
16S 6 82 87 G:C cWW   Strong C 7.3 21.2 29.1 13.3 10.9 14.5 0.6                 1.2 1.8 165 GC,CG,UA,AU,GU,UG GC,CG,UA,AU 20 21 15 0.73 0.6 0.72 1.33 0.72 0.98 0.05 0.04 0.01 0.89
16S 6.1 113 314 G:C cWW   Strong C 99.4 0.6                               164 GC GC,CG 1 1 1 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.95 1.95 0.0 0.9
16S 6.1 114 313 U:A cWW   Strong C     99.4       0.6                     164 UA   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.95 2.0 0.0 0.9
16S 6.1 115 312 G:C cWW   Strong C 99.4                   0.6             164 GC   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.95 2.0 0.0 0.9
16S 7 122 239 G:U cWW   Strong C 0.6     18.5 56.0     11.3 13.1               0.6 168 AU,GU,AC,AG GU,AG 12 11 3 0.26 0.3 0.69 1.0 0.19 0.75 1.01 0.87 0.01 0.92
16S 7 123 238 U:A cWW   Strong C   92.8 6.0 0.6                         0.6 167 CG,UA CG,UA,AU 5 4 4 0.89 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.58 1.56 0.01 0.91
16S 7 124 237 C:G cWW   Strong C 92.8     6.0                         1.2 167 GC,AU GC,AU 7 6 6 0.92 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.62 1.56 0.01 0.91
16S 7 125 236 U:A cWW   Strong C     11.4     87.3                     1.2 166 UA,UG   0 8 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 1.0 2.0 1.38 0.01 0.9
16S 7 126 235 G:C cWW   Strong C 29.3     49.1 2.4     18.6                 0.6 167 GC,AU,GU,AC GC,AU 6 9 4 0.53 0.58 0.79 1.37 0.79 0.81 1.1 0.94 0.01 0.91
16S 7 127 234 G:C cWW   Strong C 1.2     97.6 0.6                       0.6 167 AU GC,AU 4 3 3 0.86 0.67 0.99 1.66 0.99 1.0 1.87 1.84 0.01 0.91
16S 7 128 233 G:C cWW   Strong C 97.0     1.8                         1.2 167 GC GC,AU 2 2 2 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.87 1.75 0.01 0.91
16S 7 129 232 A:G cWW 3°: base pair Strong C     0.6 4.8   1.8     91.0       0.6 0.6     0.6 167 AU,AG UA,AG 6 6 1 0.17 0.07 0.0 0.07 0.05 0.07 1.75 1.57 0.01 0.91
16S 7 131 231 A:U cWW   Strong C   50.6 48.2                     0.6     0.6 166 CG,UA CG,UA 7 7 7 1.0 0.99 0.99 1.98 0.99 0.99 0.95 0.94 0.01 0.91
16S 7 132 230 C:G cWW   Strong C 0.6 83.7 12.0 0.6   1.8 0.6                   0.6 166 CG,UA GC,CG,UA,AU 12 9 7 0.67 0.85 0.98 1.82 0.98 0.99 1.27 1.27 0.01 0.91
16S 7 136 227 C:G cWW   Strong C 3.6 88.0 4.2 0.6   0.6 1.8     0.6   0.6           167 GC,CG,UA GC,CG,UA,AU 8 9 7 0.82 0.7 0.96 1.66 0.96 0.97 1.34 1.34 0.0 0.92
16S 7 137 226 U:G cWW   Strong C   58.1 38.3 0.6           1.2     0.6     1.2   167 CG,UA CG,UA,AU 10 9 8 0.84 0.93 0.97 1.9 0.97 0.97 0.93 0.91 0.0 0.92
16S 7 138 225 G:C cWW   Strong C   6.6 69.5 3.0   17.4       1.8           1.8   167 CG,UA,AU,UG CG,UA,AU 11 17 6 0.43 0.31 0.79 1.1 0.79 0.96 1.4 0.92 0.0 0.92
16S 7 139 224 A:U cWW   Strong C   3.6 67.1 1.8 0.6 22.8 1.2 0.6         1.2     1.2   167 CG,UA,UG CG,UA,AU 8 13 5 0.48 0.16 0.0 0.16 0.72 0.96 1.43 0.91 0.0 0.92
16S 7 140 223 U:A cWW   Strong C 33.5 6.0 10.8 39.5 5.4 0.6   0.6 0.6 0.6         0.6 0.6 1.2 167 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 14 16 11 0.73 0.85 0.91 1.76 0.91 0.97 0.2 0.32 0.01 0.91
16S 7 141 222 G:C cWW   Strong C 94.0 0.6 0.6 3.6 0.6                     0.6   167 GC,AU GC,CG,UA,AU 5 5 5 1.0 0.8 0.99 1.79 0.99 0.99 1.63 1.62 0.0 0.92
16S 7 142 221 G:C cWW   Strong C 92.2 0.6 1.2 3.6 0.6 0.6   0.6             0.6     167 GC,AU GC,CG,UA,AU 5 6 5 0.91 0.69 0.98 1.67 0.98 0.99 1.54 1.57 0.0 0.92
16S 8 144 178 G:C cWW   Strong C 76.8 3.6 3.0 8.3 2.4   0.6 1.2       0.6 1.2       2.4 168 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 11 13 10 0.83 0.71 0.94 1.65 0.94 0.96 0.89 0.88 0.02 0.9
16S 8 145 177 G:G cWW 3°: base pair Strong C 72.6     17.9 1.8   0.6 0.6         0.6 3.6     2.4 168 GC,AU,GG GC,AU 9 16 7 0.56 0.71 0.93 1.64 0.93 0.94 1.09 0.91 0.02 0.9
16S 8 146 176 G:C cWW   Strong C 81.0   1.2 14.3 1.2   0.6       0.6           1.2 168 GC,AU GC,UA,AU 8 8 7 0.88 0.87 0.98 1.84 0.98 0.99 1.14 1.2 0.01 0.91
16S 8 147 175 G:C cWW   Strong C 94.0   0.6 1.8 1.2   1.8                   0.6 168 GC GC,UA,AU 3 3 0 0.0 0.33 0.96 1.3 0.97 0.98 1.66 1.58 0.0 0.92
16S 8 152 169 A:C tHW 3°: base pair Strong C     0.6 3.0     1.8 89.9 1.8   0.6     0.6     1.8 168 AU,AC UA,AC,GG 2 5 1 0.29 0.14 0.0 0.14 0.04 0.04 1.73 1.32 0.01 0.91
16S 8 153 168 C:G cWW   Strong C   91.7 0.6     1.8 0.6     1.8 0.6           3.0 168 CG CG,AA 3 3 2 0.67 0.11 0.0 0.11 0.95 0.97 1.56 1.51 0.02 0.9
16S 8 154 167 U:A cWW   Strong C 1.2 5.4 9.5 73.8 1.2   1.2   1.2     0.6       4.8 1.2 168 CG,UA,AU,UU GC,CG,UA,AU 14 15 7 0.48 0.64 0.91 1.55 0.91 0.92 0.83 0.99 0.01 0.91
16S 8 155 166 A:U cWW   Strong C 42.8 1.2 4.2 26.5 11.4 3.0 1.2 1.8             1.8 4.8 1.2 166 GC,UA,AU,GU,UG,UU GC,CG,UA,AU 19 22 7 0.34 0.57 0.76 1.33 0.76 0.9 0.44 0.47 0.01 0.9
16S 8 156 165 C:G cWW   Strong C   57.5 24.6 6.0 1.2 5.4     1.2 1.2   0.6   0.6   1.2 0.6 167 CG,UA,AU,UG CG,UA,AU 19 18 11 0.59 0.73 0.89 1.61 0.89 0.95 0.59 0.72 0.0 0.91
16S 8 157 164 U:G cWW   Strong C 4.8 3.0 6.5 0.6 6.0 78.0 0.6                   0.6 168 GC,CG,UA,GU,UG GU,UG,AA 9 12 5 0.48 0.31 0.85 1.16 0.15 0.99 1.17 0.96 0.0 0.92
16S 8 158 163 G:C cWW   Strong C 89.9 1.2 3.0 2.4 1.2   0.6 0.6             0.6   0.6 168 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 8 9 6 0.71 0.69 0.97 1.66 0.97 0.98 1.4 1.38 0.0 0.92
16S 9 184 193 G:C cWW   Strong C 33.7 1.2 3.6 7.1 52.7             0.6         1.2 169 GC,UA,AU,GU CG,UA,GU 6 5 0 0.0 0.1 0.0 0.1 0.46 0.99 1.17 0.69 0.0 0.92
16S 9 185 192 U:A cWW   Strong C   89.9 4.1 3.6   0.6       0.6             1.2 169 CG,UA,AU CG,UA,AU 6 6 6 1.0 0.87 0.99 1.85 0.99 0.99 1.39 1.39 0.0 0.92
16S 9 186 191 C:G cWW   Strong C   14.9 76.2 1.8 0.6 4.8       0.6             1.2 168 CG,UA,UG CG,UA,AU 9 9 7 0.78 0.74 0.94 1.68 0.94 0.99 1.09 0.99 0.0 0.91
16S 10 198 219 G:U cWW   Strong C 61.5 4.1 0.6 18.3 5.9   0.6 0.6 0.6       1.2 0.6 0.6 1.8 3.6 169 GC,CG,AU,GU GC,CG,UA,AU 17 19 8 0.44 0.66 0.88 1.54 0.88 0.94 0.64 0.48 0.01 0.9
16S 10 199 218 A:U cWW   Strong C 64.5 1.2 0.6 23.7 4.1     0.6     0.6 0.6   0.6     3.6 169 GC,AU,GU GC,CG,UA,AU 10 11 5 0.48 0.8 0.93 1.73 0.93 0.97 0.75 0.7 0.01 0.9
16S 10 200 217 G:C cWW   Strong C 1.2 0.6 15.4 60.4 0.6 0.6 0.6       0.6 1.2 0.6 1.2   0.6 16.6 169 UA,AU GC,CG,UA,AU 12 10 7 0.64 0.74 0.93 1.67 0.93 0.94 0.07 0.17 0.02 0.78
16S 10 201 216 G:U cWW   Strong C 3.6 0.6 4.1 5.3 0.6 1.8 0.6 0.6               0.6 82.3 169 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 3 2 0 0.0 0.67 0.77 1.43 0.77 0.9 -0.62 -0.68 0.01 0.17
16S 10 202 215 G:C cWW   Strong C     7.7 0.6   0.6                 0.6   90.6 169 UA UA,AU 1 3 1 0.5 0.01 0.0 0.01 0.08 0.09 -0.33 -0.41 0.0 0.0
16S 10 203 214 G:C cWW   Strong C 1.2 0.6 1.2 1.8 1.2   0.6             0.6     92.9 169   GC,CG,UA,AU 2 1 0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.05 0.06 -0.37 -0.36 0.0 0.0
16S 10 206 213 C:G cWW   Strong C   0.6   2.4                         97.1 169 AU CG,AU 0 0 0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.03 -0.17 -0.29 0.0 0.0
16S 10 207 212 C:G cWW   Strong C     1.8 1.2     0.6                   96.5 169   UA,AU 1 1 1 1.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.03 -0.19 -0.25 0.0 0.0
16S 11 240 286 G:C cWW   Strong C   97.6 1.2             0.6             0.6 169 CG CG,UA 2 3 2 0.8 0.67 0.99 1.66 0.99 0.99 1.84 1.81 0.01 0.92
16S 11 241 285 G:C cWW   Strong C   1.2 97.6                   0.6       0.6 169 UA CG,UA 3 2 2 0.8 0.67 0.99 1.66 0.99 0.99 1.79 1.87 0.01 0.92
16S 11 242 284 G:C cWW   Strong C 97.0     1.8                 0.6       0.6 169 GC GC,AU 2 2 2 1.0 0.75 0.99 1.74 0.99 0.99 1.81 1.82 0.01 0.92
16S 11 245 283 U:U cWW 3°: base pair Strong C           0.6           0.6       98.8   170 UU   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.95 1.95 0.0 0.93
16S 11 247 277 G:C cWW   Strong C 97.1     0.6 2.4                         170 GC,GU GC,AU 1 2 0 0.0 0.2 0.0 0.2 0.98 1.0 1.95 1.81 0.0 0.93
16S 11 248 276 C:G cWW   Strong C   95.3 2.9     1.8                       170 CG,UA CG,UA 5 3 3 0.75 0.62 0.98 1.61 0.98 1.0 1.73 1.81 0.0 0.93
16S 11 249 275 U:G cWW   Strong C           97.6       2.4               170 UG,CA UG,CA 1 1 1 1.0 1.0 1.0 2.0 0.0 0.98 1.84 1.84 0.0 0.93

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Advanced export

JSON shape: default, array, newline-delimited

CSV options: 

CREATE VIEW basepair_combined as
select f.molecule, f.helix_number, f.position_1, f.position_2,
       f.reference_base_pair, f.conformation, f.tertiary_type, f.strength, f.group_code,
       f.GC, f.CG, f.UA, f.AU, f.GU, f.UG, f.AA, f.AC, f.AG, f.CA, f.CC, f.CU, f.GA, f.GG, f.UC, f.UU, f.gap, f.Seq as sequences,
       f.predominant_types, f.covarying_types,
       s.Xch, s.Ych, s.PE, s.PES, s.Cov1, s.Cov3, s."C1+C3" as C1_C3,
       s.WC, s.WCGU, s.XCons, s.YCons, s.DfDel, s.PNuc
from basepair_frequency f
left join basepair_collective_score s
  on s.molecule = f.molecule and s.position_1 = f.position_1
 and s.position_2 = f.position_2 and s.group_code = f.group_code;