Base-pair statistics (frequencies and scores together) (view)

predominant_types
Base-pair types shown in bold in the published table (most frequent).
covarying_types
Base-pair types marked * in the published table (involved in a covariation).
sequences
Number of sequences in the group.

1,247 rows where group_code = "B" and strength = "Strong" sorted by position_1

✎ View and edit SQL

This data as json, CSV (advanced)

Suggested facets: reference_base_pair, CC, CU, DfDel

conformation 11

molecule 3

strength 1

  • Strong · 1,247 ✖

group_code 1

  • B · 1,247 ✖
molecule helix_number position_1 ▼ position_2 reference_base_pair conformation tertiary_type strength group_code GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap sequences predominant_types covarying_types Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1_C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc
23S 1 1 2902 G:C cWW   Strong B 69.9 1.2 3.5 10.4 4.0   2.3         0.6       0.6 7.5 173 GC,UA,AU,GU,AA GC,CG,UA,AU 11 10 3 0.29 0.67 0.92 1.58 0.92 0.96 0.63 0.73 0.05 0.49
5S 1 1 119 U:A cWW   Strong B 18.8   35.4 9.7 0.7 5.6 1.4 2.1 1.4 1.4 0.7 0.7     1.4 11.8 9.0 144 GC,UA,AU,UG,AC,UU GC,UA,AU                          
23S 1 2 2901 G:C cWW   Strong B 63.6 0.6 5.2 23.1 2.9   1.2 0.6       0.6     1.2   1.2 173 GC,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 10 11 4 0.38 0.82 0.94 1.75 0.94 0.96 0.52 0.8 0.01 0.53
5S 1 2 118 G:C cWW   Strong B 54.8 2.7 10.5 10.0 1.4 4.1 1.4 5.5     0.5 0.5 0.9   1.8 1.8 4.1 219 GC,CG,UA,AU,UG,AC GC,CG,UA,AU                          
23S 1 3 2900 U:A cWW   Strong B 6.9 4.6 69.9 4.0 1.2 1.7       1.7   5.2       2.9 1.8 173 GC,CG,UA,AU,CU,UU GC,UA,CU 7 10 5 0.59 0.43 0.83 1.26 0.87 0.9 0.38 0.63 0.01 0.52
5S 1 3 117 C:G cWW   Strong B 2.1 50.9 18.6 1.1   20.7   0.4     0.4 0.7 0.4 0.7 1.4 1.4 1.4 285 GC,CG,UA,UG GC,CG,UA,AU                          
23S 1 4 2899 U:A cWW   Strong B 1.2 42.8 49.1 2.3   1.2 1.2   0.6 0.6             1.2 173 CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 12 15 10 0.74 0.93 0.96 1.9 0.96 0.98 0.61 0.77 0.01 0.53
5S 1 4 116 C:G cWW   Strong B 2.3 60.9 14.7 1.7 1.0 15.7       0.3 0.7 0.3 0.7   0.3 0.3 1.0 299 GC,CG,UA,UG GC,CG,UA,AU                          
23S 1 5 2898 A:U cWW   Strong B   0.6   98.9                         0.6 174 AU CG,AU 3 1 0 0.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.66 1.95 0.01 0.53
5S 1 5 115 U:A cWW   Strong B 3.3 18.4 70.6 0.3   3.0 0.3   2.3 0.3             1.3 299 GC,CG,UA,UG,AG GC,CG,UA,AU                          
23S 1 6 2897 A:U cWW   Strong B 0.6     98.9 0.6                         174 AU GC,AU 2 2 1 0.5 0.5 0.99 1.49 0.99 1.0 1.85 1.91 0.01 0.53
5S 1 6 114 G:C cWW   Strong B 89.7 1.3 0.3 4.7 1.7 1.0         0.3 0.3         0.7 300 GC,AU GC,CG,UA,AU                          
23S 1 7 2896 G:C cWW   Strong B 95.5   0.6 3.4             0.6             177 GC,AU GC,UA,AU 5 4 4 0.89 0.88 0.99 1.87 0.99 0.99 1.64 1.66 0.01 0.54
5S 1 7 113 G:C cWW   Strong B 89.4   0.3 7.6 1.3     0.3             0.3   0.7 301 GC,AU GC,UA,AU                          
5S 1 8 112 C:G cWW   Strong B 2.0 39.5 1.3 1.3   55.1               0.3     0.3 301 CG,UG GC,AU,UG                          
16S 1 9 25 G:C cWW   Strong B 97.2       1.2 0.1   1.2           0.1 0.3   0.1 1946 GC GC,UG 13 7 1 0.1 0.02 0.0 0.02 0.97 0.98 1.86 1.85 0.0 0.33
5S 1 9 111 G:U cWW   Strong B 63.6 0.7 0.7 3.6 28.8 0.7                     2.0 302 GC,AU,GU GC,CG,UA,AU                          
16S 1 10 24 A:U cWW   Strong B       96.2 2.8       0.1     0.6       0.1   2016 AU,GU   14 8 1 0.09 0.01 0.0 0.01 0.96 0.99 1.73 1.9 0.0 0.34
5S 1 10 110 G:C cWW   Strong B 39.4 4.3 6.6 43.7 2.6 0.7 1.3 0.7 0.3               0.3 302 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU                          
16S 1 11 23 G:C cWW   Strong B 99.1     0.2       0.4                 0.1 2053 GC GC,AU 6 4 1 0.2 0.27 0.99 1.26 0.99 0.99 1.91 1.94 0.0 0.35
16S 1 12 22 U:G cWW   Strong B   0.4       98.6     0.1         0.2 0.1 0.1 0.2 2131 UG   6 6 1 0.17 0.08 0.0 0.08 0.01 0.99 1.88 1.91 0.0 0.36
23S 2 15 525 G:U cWW   Strong B 1.6   0.8   97.6                         247 GU UA,GU 1 4 1 0.4 0.33 0.98 1.32 0.02 1.0 1.93 1.83 0.0 0.76
23S 2 16 524 C:G cWW   Strong B 42.3 14.6 8.5 28.0 6.5                         246 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 11 16 9 0.67 0.89 0.94 1.82 0.94 1.0 0.28 0.27 0.0 0.76
5S 2 16 68 G:C cWW   Strong B 86.4 3.3 5.3 1.0 1.7 1.3   0.3     0.3   0.3         302 GC,CG,UA GC,CG,UA,AU                          
16S 2 17 918 U:A cWW 3°: pseudoknot Strong B     99.1     0.1             0.1     0.2 0.2 2163 UA   1 3 0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.99 0.99 1.95 1.96 0.0 0.37
23S 2 17 523 G:C cWW   Strong B 96.8       3.2                         250 GC,GU   0 4 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 1.0 2.0 1.81 0.0 0.77
5S 2 17 67 C:G cWW   Strong B 2.0 75.5 3.0 5.3   5.6 0.3     6.6             1.7 302 CG,UA,AU,UG,CA GC,CG,UA,AU                          
16S 2 18 917 C:G cWW 3°: pseudoknot Strong B   95.2 3.0     0.7     0.2 0.5   0.1         0.1 2163 CG,UA CG,UA 24 18 10 0.48 0.64 0.98 1.62 0.98 0.99 1.7 1.75 0.0 0.37
23S 2 18 522 U:A cWW   Strong B   81.2 17.2     1.2 0.4                     250 CG,UA CG,UA 5 4 3 0.67 0.92 0.98 1.9 0.98 1.0 1.27 1.37 0.0 0.77
5S 2 18 65 G:U cWW   Strong B 54.6 2.0 4.0 16.9 20.2   0.3 1.0     0.3 0.3 0.3         302 GC,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU                          
16S 2 19 916 A:U cWW 3°: pseudoknot Strong B   79.9 0.3 13.9   0.4     1.7 0.2 0.1 3.2   0.1     0.2 2190 CG,AU,CU CG,UA,AU 32 13 1 0.04 0.72 0.94 1.66 0.94 0.95 1.29 1.34 0.0 0.37
23S 2 19 521 A:U cWW   Strong B 8.8 3.2 22.7 33.1 30.3                     2.0   251 GC,CG,UA,AU,GU,UU GC,CG,UA,AU 11 11 3 0.27 0.52 0.68 1.2 0.68 0.98 0.29 0.68 0.0 0.77
5S 2 19 64 C:G cWW   Strong B 22.8 14.9 26.2 31.1 2.0 0.7 0.3 0.3   0.3     0.3 0.3 0.3 0.3   302 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU                          
23S 2 20 520 C:G cWW   Strong B 2.0 45.0 25.9 22.7   2.0       1.2           0.8 0.4 251 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 13 14 9 0.67 0.93 0.96 1.89 0.96 0.98 0.33 0.4 0.0 0.77
5S 2 20 63 G:C cWW   Strong B 30.1 8.9 23.8 29.8 3.3 0.7                 0.7 2.6   302 GC,CG,UA,AU,GU,UU GC,CG,UA,AU                          
23S 2 21 519 A:U cWW   Strong B 8.8 2.0 6.4 58.6 1.2 21.5     0.8             0.8   251 GC,CG,UA,AU,UG GC,AU,UG 13 14 7 0.52 0.73 0.89 1.62 0.76 0.98 0.59 0.53 0.0 0.77
5S 2 21 62 G:C cWW   Strong B 57.6 4.3 14.6 15.9 3.6 1.7   0.3 0.3       0.3     1.3   302 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU                          
23S 2 22 518 C:G cWW   Strong B 0.8 43.6 32.4 3.2   18.8         0.8           0.4 250 CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 12 13 4 0.32 0.65 0.8 1.45 0.8 0.99 0.73 0.75 0.0 0.76
5S 2 22 61 U:G cWW   Strong B 29.1 5.3 11.6 22.5 1.0 29.8                   0.7   302 GC,CG,UA,AU,UG GC,AU,UG                          
23S 2 23 517 G:C cWW   Strong B 99.6     0.4                           251 GC GC,AU 1 1 1 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.96 1.97 0.0 0.77
5S 2 23 60 G:C cWW   Strong B 82.1 1.7   3.0 0.3 0.3   0.3         4.3 1.0 4.7 2.0 0.3 301 GC,AU,GA,UC GC,CG,AU                          
23S 2 24 516 G:C cWW   Strong B 98.4     1.6                           250 GC GC,AU 3 5 3 0.75 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.88 1.87 0.0 0.77
16S 3 27 556 G:C cWW   Strong B 99.3             0.2     0.1       0.1   0.2 2600 GC   3 1 1 0.5 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.92 1.98 0.0 0.44
16S 3 28 555 A:U cWW   Strong B 51.4 0.2   46.9 1.0     0.1     0.1           0.1 3080 GC,AU GC,CG,AU 12 12 5 0.42 0.97 0.99 1.96 0.99 1.0 0.95 0.97 0.0 0.53
5S 2 28 56 C:G cWW   Strong B   46.0   4.3 0.3           1.0 46.0     1.3 1.0   302 CG,AU,CU CG,AU,UC                          
16S 3 29 554 U:A cWW   Strong B 10.0   21.2 67.7 0.3     0.1       0.2 0.1     0.3   3182 GC,UA,AU GC,UA,AU 28 31 19 0.64 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 0.76 0.79 0.0 0.54
5S 2 29 55 A:U cWW   Strong B 9.6   0.3 89.7 0.3                         302 GC,AU GC,UA,AU                          
16S 3 30 553 U:A cWW   Strong B 0.1 50.4 47.0     1.6 0.1   0.1 0.3   0.1 0.1     0.1   3238 CG,UA GC,CG,UA 41 47 27 0.61 0.95 0.98 1.93 0.98 0.99 0.94 0.96 0.0 0.55
23S 2 30 510 G:C cWW 3°: base pair Strong B 97.6       1.2   1.2                     250 GC GC,AA 1 3 0 0.0 0.5 0.99 1.49 0.98 0.99 1.91 1.81 0.0 0.77
5S 2 30 54 C:G cWW   Strong B   99.3       0.3         0.3             302 CG                            
23S 3 31 474 C:G cWW   Strong B   98.4 1.2                 0.4           249 CG CG,UA 2 3 2 0.8 0.75 1.0 1.75 1.0 1.0 1.91 1.88 0.0 0.76
5S 2 31 51 C:G cWW   Strong B   88.1 5.0     0.7 1.0     3.6     0.3   1.3     302 CG,UA,CA CG,UA                          
16S 3 32 552 A:U cWW   Strong B     0.2 98.8 0.4   0.1 0.1       0.1       0.2 0.1 3333 AU UA,AU 6 7 1 0.15 0.14 0.0 0.14 0.99 0.99 1.89 1.92 0.0 0.57
23S 3 32 473 C:G cWW   Strong B   99.6                 0.4             251 CG   0 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 1.97 0.0 0.77
5S 2 32 50 U:A cWW   Strong B 0.3 57.6 40.1     1.3       0.3 0.3             302 CG,UA GC,CG,UA                          
16S 3 33 551 A:U cWW   Strong B       99.6 0.2                         3361 AU   4 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.96 1.97 0.0 0.57
5S 2 33 49 G:C cWW   Strong B 81.1 10.6 0.7 6.6 0.3 0.3               0.3       302 GC,CG,AU GC,CG,UA,AU                          
16S 3 34 550 C:G cWW   Strong B   98.6 0.3     0.1     0.3   0.1 0.1   0.3     0.2 3444 CG CG,UA 8 8 3 0.38 0.29 0.99 1.28 0.99 0.99 1.89 1.92 0.0 0.59
5S 2 34 48 A:U cWW   Strong B 13.2   32.8 53.6 0.3                         302 GC,UA,AU GC,UA,AU                          
23S 4 35 445 G:C cWW   Strong B 100.0                                 251 GC   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.77
16S 3 36 548 C:G cWW   Strong B   96.2 2.4     0.2     0.1 0.2 0.1 0.1   0.3     0.3 3539 CG,UA CG,UA 13 14 6 0.44 0.69 0.99 1.68 0.99 0.99 1.75 1.79 0.0 0.6
23S 4 36 444 G:C cWW   Strong B 94.8 1.2   2.4       1.2     0.4             251 GC,AU GC,CG,AU 3 2 1 0.4 0.69 0.98 1.68 0.98 0.98 1.66 1.71 0.0 0.77
23S 4 37 442 C:G cWW   Strong B 1.2 94.8 0.4 2.4   0.8               0.4       250 CG,AU GC,CG,UA,AU 5 4 3 0.67 0.77 0.99 1.76 0.99 1.0 1.63 1.73 0.0 0.77
23S 4 38 441 A:U cWW   Strong B 16.0   4.4 79.6                           250 GC,UA,AU GC,UA,AU 12 13 11 0.88 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.12 1.13 0.0 0.77
23S 4 39 440 G:C cWW   Strong B 16.8 40.8 28.4 13.2   0.4   0.4                   250 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 12 13 8 0.64 0.99 0.99 1.98 0.99 1.0 0.13 0.19 0.0 0.77
16S 4 40 402 C:G cWW   Strong B   98.5 0.7     0.2     0.2   0.1     0.2       3915 CG CG,UA 12 6 4 0.44 0.5 0.99 1.49 0.99 0.99 1.89 1.88 0.0 0.67
23S 4 40 439 U:A cWW   Strong B 3.2 22.2 70.2 4.0                   0.4       248 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 14 15 14 0.97 0.99 1.0 1.98 1.0 1.0 0.81 0.79 0.0 0.76
16S 4 41 401 G:C cWW   Strong B 94.6   2.3 2.1 0.3     0.1     0.1     0.1 0.1   0.3 3896 GC,UA,AU GC,UA,AU 16 18 12 0.71 0.86 0.99 1.85 0.99 1.0 1.65 1.66 0.0 0.66
23S 4 41 438 C:G cWW   Strong B 30.8 25.2 4.4 39.2                         0.4 250 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 17 15 14 0.88 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 0.24 0.22 0.0 0.76
16S 4 42 400 G:C cWW   Strong B 96.7     2.4 0.3     0.1     0.2       0.1   0.3 3959 GC,AU GC,AU 15 12 6 0.44 0.78 0.99 1.77 0.99 1.0 1.78 1.82 0.0 0.67
23S 4 42 437 A:U cWW   Strong B 34.0   2.4 63.2 0.4                         250 GC,UA,AU GC,UA,AU 10 11 8 0.76 0.99 1.0 1.99 1.0 1.0 0.92 0.9 0.0 0.77
16S 4 43 399 C:G cWW   Strong B 0.8 88.1 7.1 1.2   0.9     0.1 0.4 0.6 0.2   0.3 0.1   0.2 3943 CG,UA GC,CG,UA,AU 48 57 31 0.59 0.78 0.97 1.75 0.97 0.98 1.4 1.38 0.0 0.67
23S 4 43 436 G:C cWW   Strong B 58.0 27.2 1.6 4.4     6.4   1.6               0.8 250 GC,CG,AU,AA GC,CG,AA 13 13 11 0.85 0.82 0.92 1.74 0.92 0.92 0.49 0.41 0.0 0.76
16S 4 44 398 A:U cWW   Strong B 53.1 0.1   44.4 0.4   1.2 0.3                 0.2 4002 GC,AU GC,CG,AU 34 39 29 0.8 0.95 0.98 1.93 0.98 0.98 0.96 0.9 0.0 0.68
23S 4 44 434 A:U cWW   Strong B 0.4     99.6                           249 AU GC,AU 1 2 1 0.67 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.96 1.93 0.0 0.76
16S 4 45 396 G:C cWW   Strong B 27.0 5.3 37.2 0.8 0.2 25.2       0.1     0.2 0.1 3.6   0.2 3969 GC,CG,UA,UG,UC GC,CG,UA,AU 37 65 19 0.37 0.53 0.7 1.24 0.7 0.96 0.78 0.34 0.0 0.68
23S 4 45 433 G:C cWW   Strong B 97.2 0.4   2.4                           249 GC,AU GC,CG,AU 2 2 2 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.8 1.82 0.0 0.76
16S 4 46 395 G:C cWW   Strong B 99.2     0.1       0.1     0.1     0.1 0.1   0.1 4020 GC GC,AU 8 3 1 0.18 0.19 0.0 0.19 0.99 0.99 1.93 1.96 0.0 0.69
23S 4.1 46 179 G:C cWW   Strong B 63.6 32.4 2.8                     0.8     0.4 250 GC,CG,UA GC,CG,UA 5 4 5 1.0 0.98 0.99 1.97 0.99 0.99 0.92 0.8 0.01 0.76
16S 5 47 361 C:G cWW 3°: base pair Strong B   92.6 3.9     0.5             1.6 0.7     0.3 4038 CG,UA CG,UA 6 3 3 0.67 0.57 0.97 1.54 0.97 0.97 1.55 1.67 0.0 0.69
23S 4.1 47 178 C:G cWW   Strong B   98.8       1.2                       249 CG   1 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 1.0 1.91 1.97 0.0 0.76
16S 5 52 359 C:G cWW   Strong B 2.2 72.8 19.1 3.6 1.0 0.2   0.1 0.2 0.1 0.2 0.2   0.1       4113 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 37 32 25 0.72 0.92 0.98 1.89 0.98 0.99 0.88 0.89 0.0 0.7
16S 5 53 358 A:U cWW   Strong B 3.8 0.1   94.0 1.6     0.1       0.1       0.1 0.1 4095 GC,AU GC,CG,AU 16 9 6 0.48 0.65 0.98 1.63 0.98 1.0 1.66 1.75 0.0 0.7
23S 5 54 116 G:C cWW   Strong B 95.7     4.0 0.4                         253 GC,AU GC,AU 2 3 2 0.8 0.91 1.0 1.91 1.0 1.0 1.76 1.75 0.0 0.78
23S 5 55 115 G:C cWW   Strong B 99.6       0.4                         252 GC   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 1.96 0.0 0.77
23S 5 56 114 A:U cWW   Strong B 3.2   2.4 93.7 0.4     0.4                   253 GC,UA,AU GC,UA,AU 4 6 2 0.4 0.88 0.99 1.87 0.99 1.0 1.62 1.6 0.0 0.78
16S 5 57 355 G:C cWW   Strong B 98.8       0.1     0.3     0.4   0.1 0.1 0.2     4194 GC   11 3 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.99 1.91 1.97 0.0 0.71
23S 6 57 70 C:G cWW   Strong B   86.9 12.7     0.4                       252 CG,UA CG,UA 2 1 1 0.67 0.97 1.0 1.97 1.0 1.0 1.44 1.46 0.0 0.77
23S 6 58 69 G:C cWW   Strong B 100.0                                 252 GC   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 0.0 0.77
23S 6 59 68 U:G cWW   Strong B 13.4 27.2 11.0     48.4                       254 GC,CG,UA,UG GC,UG 8 6 3 0.43 0.26 0.62 0.88 0.52 1.0 0.66 0.95 0.0 0.78
16S 6 61 106 G:C cWW   Strong B 98.5     0.3 0.2     0.1     0.2     0.3     0.3 4392 GC GC,AU 9 10 2 0.21 0.29 0.99 1.29 0.99 0.99 1.91 1.9 0.0 0.75
23S 6.1 61 93 C:G cWW 3°: pseudoknot Strong B 32.7 18.5 14.2 25.2   0.4   9.1                   254 GC,CG,UA,AU,AC GC,CG,UA,AU 16 17 12 0.73 0.86 0.91 1.76 0.91 0.91 0.09 0.12 0.0 0.78
23S 6.1 62 92   cWW 3°: pseudoknot Strong B 8.9 26.8 31.1 1.6 0.4 0.8 6.6   1.9 0.4     1.6     19.5 0.4 257 GC,CG,UA,AA,UU GC,CG,UA,AU 15 12 9 0.67 0.55 0.69 1.23 0.69 0.7 0.3 0.12 0.0 0.79
16S 6 63 104 C:G cWW   Strong B 0.1 98.0 0.7 0.3   0.2       0.1 0.1     0.1     0.2 4402 CG GC,CG,UA,AU 14 12 8 0.61 0.65 0.99 1.64 0.99 1.0 1.86 1.84 0.0 0.75
23S 6.1 65 89 U:A cWW 3°: pseudoknot Strong B 15.6 39.7 11.3 24.1 8.2                 0.8   0.4   257 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 15 17 14 0.88 0.84 0.91 1.75 0.91 0.99 0.12 0.17 0.0 0.79
16S 6 66 103 A:U cWW   Strong B 43.8   0.4 53.9 0.9     0.4       0.1   0.1 0.1   0.2 4409 GC,AU GC,UA,AU 85 80 61 0.74 0.96 0.98 1.95 0.98 0.99 0.94 0.94 0.0 0.75
16S 6 67 102 C:G cWW   Strong B 3.4 94.5 0.3 0.1 0.1       0.1 0.5 0.2 0.1   0.3     0.3 4438 GC,CG GC,CG,UA,AU 28 35 18 0.57 0.73 0.99 1.71 0.99 0.99 1.69 1.65 0.0 0.76
23S 6.2 67 74 U:A cWH 3°: pseudoknot Strong B 2.7 2.7 71.9 10.5 6.6         0.4     0.4   0.4 3.9 0.4 256 GC,CG,UA,AU,GU,UU GC,CG,UA,AU 8 10 3 0.33 0.58 0.88 1.46 0.88 0.95 0.84 0.9 0.0 0.78
16S 6 69 99 G:C cWW   Strong B 43.5 9.2 0.5 19.0 13.6 0.2 0.4 0.3 1.5 0.1 0.1 0.6 0.5 0.8     9.5 4378 GC,CG,AU,GU GC,CG,UA,AU 99 116 40 0.37 0.61 0.8 1.41 0.8 0.95 0.2 -0.02 0.01 0.68
16S 6 70 98 U:A cWW   Strong B 8.2 15.9 22.9 30.7 6.9 1.2 0.3 0.2 0.2 0.1 0.2   0.7 0.3   0.3 11.5 4404 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 158 157 96 0.61 0.81 0.88 1.69 0.88 0.97 -0.42 -0.35 0.01 0.67

Next page

Advanced export

JSON shape: default, array, newline-delimited

CSV options: 

CREATE VIEW basepair_combined as
select f.molecule, f.helix_number, f.position_1, f.position_2,
       f.reference_base_pair, f.conformation, f.tertiary_type, f.strength, f.group_code,
       f.GC, f.CG, f.UA, f.AU, f.GU, f.UG, f.AA, f.AC, f.AG, f.CA, f.CC, f.CU, f.GA, f.GG, f.UC, f.UU, f.gap, f.Seq as sequences,
       f.predominant_types, f.covarying_types,
       s.Xch, s.Ych, s.PE, s.PES, s.Cov1, s.Cov3, s."C1+C3" as C1_C3,
       s.WC, s.WCGU, s.XCons, s.YCons, s.DfDel, s.PNuc
from basepair_frequency f
left join basepair_collective_score s
  on s.molecule = f.molecule and s.position_1 = f.position_1
 and s.position_2 = f.position_2 and s.group_code = f.group_code;