Base-pair statistics (frequencies and scores together) (view)

predominant_types
Base-pair types shown in bold in the published table (most frequent).
covarying_types
Base-pair types marked * in the published table (involved in a covariation).
sequences
Number of sequences in the group.

1,330 rows where conformation = "cWW" and group_code = "E" sorted by position_1

✎ View and edit SQL

This data as json, CSV (advanced)

Suggested facets: reference_base_pair, PE

strength 5

molecule 3

group_code 1

  • E · 1,330 ✖

conformation 1

  • cWW · 1,330 ✖
molecule helix_number position_1 ▼ position_2 reference_base_pair conformation tertiary_type strength group_code GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap sequences predominant_types covarying_types Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1_C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc
23S 1 1 2902 G:C cWW   Strong E                                 100.0 40     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.35 -0.29 0.05 0.0
5S 1 1 119 U:A cWW   Strong E                                 100.0 1                              
23S 1 2 2901 G:C cWW   Strong E                                 100.0 40     1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.39 -0.29 0.04 0.0
5S 1 2 118 G:C cWW   Strong E                                 100.0 1                              
23S 1 3 2900 U:A cWW   Strong E                                 100.0 41     0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.33 -0.29 0.05 0.0
5S 1 3 117 C:G cWW   Strong E 49.7 0.3 0.7 46.2 1.7   0.3 1.0                   292 GC,AU GC,CG,UA,AU                          
23S 1 4 2899 U:A cWW   Strong E             2.4                   97.5 41 AA   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.47 -0.35 0.05 0.0
5S 1 4 116 C:G cWW   Strong E 15.1 35.4 10.0 1.7 10.7 9.6   0.3 0.3         1.7   14.4 0.7 291 GC,CG,UA,GU,UG,UU GC,CG,UU                          
23S 1 5 2898 A:U cWW   Strong E         2.4                       97.5 41 GU   2 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 -0.48 -0.49 0.06 0.0
5S 1 5 115 U:A cWW   Strong E 14.3 46.8 13.3 18.1 0.7 4.4 0.3     0.7       0.3   0.3 0.7 293 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU                          
23S 1 6 2897 A:U cWW   Strong E             2.4                   97.4 41 AA   2 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.55 -0.45 0.05 0.0
5S 1 6 114 G:C cWW   Strong E 4.1 11.9 69.0 12.6   0.3 0.3 0.7             0.3 0.3 0.3 294 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU                          
23S 1 7 2896 G:C cWW   Strong E             2.4                   97.6 41 AA   3 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 -0.66 -0.45 0.03 0.0
5S 1 7 113 G:C cWW   Strong E 25.9 0.3 8.8 63.9           0.3     0.3       0.3 294 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU                          
23S 1 8 2895 C:G cWW   Weak E   2.4                             97.4 41 CG   6 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 -0.91 -0.43 0.01 0.0
5S 1 8 112 C:G cWW   Strong E 3.4 94.9     0.3 0.7         0.3     0.3       295 GC,CG GC,CG                          
16S 1 9 25 G:C cWW   Strong E   97.1 0.1     0.3     0.1 0.1 0.1     0.1     2.0 784 CG CG,UA 3 2 2 0.8 0.14 0.0 0.14 0.99 0.99 1.73 1.95 0.02 0.73
5S 1 9 111 G:U cWW   Strong E 24.1 0.7 0.3 1.0 72.1     0.3         1.0   0.3     294 GC,GU CG,UA,GU,AC                          
16S 1 10 24 A:U cWW   Strong E   0.8 92.6 5.0           0.4   0.1 0.1       1.0 793 UA,AU CG,UA,AU 3 2 2 0.8 0.9 0.99 1.9 0.99 0.99 1.5 1.63 0.01 0.74
5S 1 10 110 G:C cWW   Strong E 55.3 1.0 5.4 26.8 8.5     2.0   0.3         0.3 0.3   295 GC,UA,AU,GU,AC GC,CG,UA,AU                          
16S 1 11 23 G:C cWW   Strong E 99.0                   0.1       0.1   0.7 806 GC   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.89 1.99 0.01 0.76
16S 1 12 22 U:G cWW   Strong E 93.9     0.6 0.1     4.8     0.1           0.4 815 GC,AC GC,AU 3 4 3 0.86 0.11 0.0 0.11 0.95 0.95 1.63 1.91 0.0 0.77
23S 2 15 525 G:U cWW   Strong E 0.9 71.6 4.3 1.7 8.6       3.4 4.3   1.7 0.9   0.9   1.8 116 CG,UA,GU,AG,CA CG,UA,GU 8 11 2 0.21 0.48 0.86 1.34 0.8 0.89 0.86 0.91 0.0 0.43
23S 2 16 524 C:G cWW   Strong E 7.8 9.5 64.7 0.9 4.3 7.8     0.9 1.7 1.7           0.9 116 GC,CG,UA,GU,UG GC,CG,UA,AU 6 15 2 0.19 0.53 0.83 1.36 0.83 0.96 0.71 0.63 0.0 0.44
5S 2 16 68 G:C cWW   Strong E 22.8 65.3 11.9                             294 GC,CG,UA GC,CG,UA                          
16S 2 17 918 U:A cWW 3°: pseudoknot Strong E     96.8 0.1   1.4       0.4         0.7 0.1 0.5 812 UA UA,AU 2 2 1 0.5 0.04 0.0 0.04 0.97 0.99 1.91 1.81 0.0 0.77
23S 2 17 523 G:C cWW   Strong E   37.1 54.3 1.7 0.9 0.9           3.4         1.8 116 CG,UA,CU CG,UA,AU 6 7 4 0.61 0.88 0.95 1.83 0.95 0.96 0.72 0.67 0.0 0.43
5S 2 17 67 C:G cWW   Strong E 16.6 61.0 13.2 6.8   1.0       0.7       0.7       295 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU                          
16S 2 18 917 C:G cWW 3°: pseudoknot Strong E   85.5 7.2     0.6       6.5             0.2 825 CG,UA,CA CG,UA 2 5 1 0.29 0.5 0.93 1.43 0.93 0.93 1.58 1.34 0.0 0.78
23S 2 18 522 U:A cWW   Strong E 9.5 6.0 65.5 1.7   10.3     0.9     0.9 0.9 0.9   2.6 0.9 116 GC,CG,UA,UG,UU GC,CG,UA,AU 6 13 1 0.1 0.51 0.83 1.35 0.83 0.94 0.86 0.42 0.0 0.44
5S 2 18 65 G:U cWW   Strong E 9.8 7.1 7.5 73.2 0.3 0.3 0.7 0.7     0.3             295 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU                          
16S 2 19 916 A:U cWW 3°: pseudoknot Strong E   97.0 2.4             0.5             0.1 826 CG,UA CG,UA 0 3 0 0.0 0.83 0.99 1.83 0.99 0.99 1.82 1.79 0.0 0.78
23S 2 19 521 A:U cWW   Strong E 0.9 47.4 31.0 11.2 1.7 0.9 3.4       0.9     1.7     0.9 116 CG,UA,AU,AA GC,CG,UA,AU 9 17 7 0.54 0.83 0.91 1.75 0.91 0.94 0.31 0.47 0.0 0.44
5S 2 19 64 C:G cWW   Strong E 15.0 49.8 14.7 16.4 1.0     0.3 0.3 1.0 1.0     0.3       293 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU                          
23S 2 20 520 C:G cWW   Strong E 14.7 13.8 2.6 62.1 0.9 1.7   0.9             0.9 1.7 0.9 116 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 9 9 4 0.44 0.84 0.94 1.78 0.94 0.96 0.42 0.51 0.0 0.44
5S 2 20 63 G:C cWW   Strong E 45.1 34.8 8.9 7.2 1.7 0.3   1.7             0.3     293 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU                          
23S 2 21 519 A:U cWW   Strong E 31.9 2.6 2.6 34.5 25.0             1.7       0.9 0.9 116 GC,CG,UA,AU,GU GC,CG,UA,AU 11 16 7 0.52 0.57 0.72 1.29 0.72 0.97 0.53 0.88 0.0 0.44
5S 2 21 62 G:C cWW   Strong E 15.0 32.3 25.9 17.3 1.7 6.1     0.3 0.7   0.3   0.3       294 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU                          
23S 2 22 518 C:G cWW   Strong E   94.8 1.7     0.9       1.7             0.9 116 CG CG,UA 2 4 1 0.33 0.4 0.97 1.37 0.97 0.98 1.74 1.72 0.0 0.44
5S 2 22 61 U:G cWW   Strong E 12.6 18.7 50.7 11.9 0.7 3.7   0.3 0.7   0.3       0.3     294 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU                          
23S 2 23 517 G:C cWW   Strong E 33.6   0.9 51.7 8.6   0.9   3.4               0.9 116 GC,AU,GU,AG GC,UA,AU 8 9 3 0.35 0.73 0.87 1.6 0.87 0.96 0.87 0.86 0.0 0.44
5S 2 23 60 G:C cWW   Strong E 78.0 0.3   1.7 0.7 0.3   2.7 0.3   0.7 0.3 0.3   13.5 0.3 0.7 296 GC,AC,UC GC,CG,AU                          
23S 2 24 516 G:C cWW   Strong E 25.0   6.9 62.9   0.9   0.9   2.6             0.9 116 GC,UA,AU,CA GC,UA,AU 6 10 3 0.38 0.88 0.96 1.84 0.96 0.96 0.57 0.62 0.0 0.44
16S 3 27 556 G:C cWW   Strong E 21.0 4.9 0.2 70.8 0.5   0.6 0.1       0.1       1.8 0.1 883 GC,CG,AU GC,CG,UA,AU 8 9 5 0.59 0.9 0.97 1.86 0.97 0.97 0.83 0.98 0.0 0.84
16S 3 28 555 A:U cWW   Strong E 22.4 0.4 0.1 2.5 72.6 0.1   0.1       0.9 0.1     0.6 0.2 889 GC,AU,GU CG,UA,GU,AC 9 12 1 0.1 0.03 0.0 0.03 0.26 0.98 1.63 1.19 0.0 0.84
5S 2 28 56 C:G cWW   Strong E 0.3       0.7 1.0   0.7   0.3 4.7 75.5     14.8 1.7 0.3 298 CC,CU,UC CU,UC                          
16S 3 29 554 U:A cWW   Strong E 0.5   92.7 0.2 0.2 0.6       0.1 0.1         0.2 5.3 880 UA GC,UA,AU 2 6 2 0.5 0.35 0.99 1.34 0.99 0.99 1.5 1.82 0.04 0.79
5S 2 29 55 A:U cWW   Strong E 12.1   6.7 80.2 0.3     0.3                 0.3 298 GC,UA,AU GC,UA,AU                          
16S 3 30 553 U:A cWW   Strong E 0.7 0.7   95.8 1.7   0.4 0.1           0.1     0.6 898 AU GC,CG,AU 6 5 4 0.73 0.36 0.98 1.34 0.98 0.99 1.72 1.85 0.01 0.85
23S 2 30 510 G:C cWW 3°: base pair Strong E 30.8 44.4 1.7 17.1   4.3                     1.8 117 GC,CG,AU,UG GC,CG,UA,AU 7 8 5 0.67 0.92 0.96 1.88 0.96 1.0 0.15 0.41 0.01 0.44
5S 2 30 54 C:G cWW   Strong E 5.7 91.9 1.7 0.3                   0.3       298 GC,CG GC,CG,UA,AU                          
23S 3 31 474 C:G cWW   Strong E 2.6 4.3 55.2 28.4 0.9 2.6     0.9               5.2 116 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 4 6 2 0.4 0.89 0.95 1.85 0.95 0.99 0.42 0.34 0.06 0.42
5S 2 31 51 C:G cWW   Strong E 10.7 81.5 4.0 0.7 0.3 0.3 0.3       0.3 1.7           298 GC,CG,UA GC,CG,UA,AU                          
16S 3 32 552 A:U cWW   Strong E 2.6 0.1 93.1       0.1     0.1   0.1   2.7 0.1 0.1 1.0 897 GC,UA,GG UA,CU,GG 6 6 3 0.5 0.47 0.97 1.44 0.97 0.97 1.56 1.61 0.01 0.84
23S 3 32 473 C:G cWW   Strong E   87.1 0.9 8.6   0.9               0.9     1.8 116 CG,AU CG,UA,AU 3 2 2 0.8 0.85 0.98 1.83 0.98 0.99 1.28 1.25 0.04 0.43
5S 2 32 50 U:A cWW   Strong E 70.4 16.5 2.7 10.1   0.3                       297 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU                          
16S 3 33 551 A:U cWW   Strong E 0.2     98.3 0.1     0.1 0.1               1.1 895 AU GC,AU 2 3 2 0.8 0.4 1.0 1.4 1.0 1.0 1.87 1.94 0.01 0.84
5S 2 33 49 G:C cWW   Strong E 56.7 33.6 5.0 2.3   2.0               0.3       298 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU                          
16S 3 34 550 C:G cWW   Strong E   9.6 1.8 0.2 0.1 86.5           0.2   0.7     0.9 893 CG,UG UG,CU 10 4 2 0.29 0.02 0.0 0.02 0.12 0.99 1.36 1.78 0.01 0.84
5S 2 34 48 A:U cWW   Strong E 4.4   31.5 63.4                     0.3   0.3 298 GC,UA,AU GC,UA,AU                          
16S 3 35 549 G:C cWW   Weak E 90.8     0.1 7.1           0.1   0.2   0.3 0.2 1.1 904 GC,GU GC,UU 2 5 1 0.29 0.03 0.0 0.03 0.92 0.99 1.84 1.58 0.01 0.85
23S 4 35 445 G:C cWW   Strong E 96.5     0.9                         2.6 115 GC GC,AU 1 2 1 0.67 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.71 1.93 0.01 0.43
16S 3 36 548 C:G cWW   Strong E   98.3       0.1       0.1 0.2           1.2 909 CG   0 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.89 1.95 0.01 0.85
23S 4 36 444 G:C cWW   Strong E 96.6 0.9   0.9                         1.7 116 GC GC,CG,AU 1 2 0 0.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.7 1.85 0.01 0.43
23S 4 37 442 C:G cWW   Strong E 3.5 73.9 4.3 3.5   13.9                     0.9 115 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 7 8 2 0.27 0.45 0.86 1.31 0.86 1.0 0.83 1.29 0.0 0.43
23S 4 38 441 A:U cWW   Strong E 0.9 1.7 90.4 6.1                         0.9 115 UA,AU GC,CG,UA,AU 3 3 3 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.31 1.69 0.0 0.43
16S 4 39 403 G:C cWW   Weak E 2.4   4.0   1.5   0.8 0.4   0.1 0.1   89.7       1.0 919 GC,UA,GA AC,GA 6 10 1 0.12 0.05 0.0 0.05 0.07 0.08 1.54 1.69 0.01 0.86
23S 4 39 440 G:C cWW   Strong E   77.4 16.5 5.2                         0.9 115 CG,UA,AU CG,UA,AU 4 8 3 0.5 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.0 0.96 0.0 0.43
16S 4 40 402 C:G cWW   Strong E 0.2 0.9 95.3 0.4   0.7 0.1     0.2   0.1 0.7   0.4 0.1 0.9 917 UA GC,CG,UA,AU 8 9 6 0.71 0.4 0.98 1.38 0.98 0.98 1.7 1.75 0.01 0.86
23S 4 40 439 U:A cWW   Strong E 20.9 32.2 29.6 11.3 0.9 3.5           0.9         0.9 115 GC,CG,UA,AU,UG GC,CG,UA,AU 11 18 6 0.41 0.92 0.95 1.87 0.95 0.99 0.02 0.18 0.0 0.43
16S 4 41 401 G:C cWW   Strong E 0.9 41.2 0.7 0.4 0.1 3.2 0.2     22.5   29.7 0.1       1.1 920 CG,UG,CA,CU GC,CG,UA,AU 9 21 2 0.13 0.03 0.0 0.03 0.44 0.47 1.53 0.37 0.01 0.86
23S 4 41 438 C:G cWW   Strong E 5.2 62.6 24.3 6.1               0.9         0.9 115 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 9 17 6 0.46 0.98 0.99 1.97 0.99 0.99 0.51 0.68 0.0 0.43
16S 4 42 400 G:C cWW   Strong E   2.3 96.3     0.4       0.3             0.7 922 CG,UA CG,UA 5 6 3 0.55 0.75 0.99 1.74 0.99 1.0 1.76 1.81 0.01 0.87
23S 4 42 437 A:U cWW   Strong E 60.9 0.9 10.4 25.2 0.9     0.9                 0.9 115 GC,UA,AU GC,CG,UA,AU 11 17 8 0.57 0.95 0.98 1.94 0.98 0.99 0.6 0.48 0.0 0.43
16S 4 43 399 C:G cWW   Strong E   19.4 7.4 0.1   2.2 3.4     66.4 0.1         0.4 0.6 922 CG,UA,UG,AA,CA AU,UG,CA 13 9 4 0.36 0.07 0.0 0.07 0.27 0.29 1.25 1.14 0.01 0.87
23S 4 43 436 G:C cWW   Strong E 6.9 68.1 12.1 8.6             0.9       0.9   2.6 116 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 6 14 6 0.6 0.94 0.98 1.92 0.98 0.98 0.51 0.56 0.01 0.43
16S 4 44 398 A:U cWW   Strong E       0.5     1.8 90.2 0.2   0.8       1.3 4.3 0.9 933 AC,UU AC,UU 7 2 0 0.0 0.48 0.95 1.44 0.01 0.01 1.55 1.57 0.01 0.88
23S 4 44 434 A:U cWW   Strong E 9.6   9.6 38.3 6.1 1.7 7.8 6.1 12.2   0.9   5.2 1.7     0.9 115 GC,UA,AU,GU,AA,AC,AG,GA GC,UA,AU 8 22 1 0.07 0.31 0.58 0.89 0.58 0.66 0.61 0.0 0.01 0.43
16S 4 45 396 G:C cWW   Strong E 0.2 0.3 0.3 2.5 1.7   0.4   92.3         2.1     0.1 935 AU,AG,GG UA,GU,AG 9 5 4 0.57 0.27 0.94 1.21 0.03 0.05 1.68 1.67 0.0 0.89
23S 4 45 433 G:C cWW   Strong E   0.9 3.4 10.3 7.8 6.9 0.9 9.5     0.9       19.0 30.2 10.5 116 UA,AU,GU,UG,AC,UC,UU CG,AC,UU 6 17 2 0.17 0.17 0.0 0.17 0.16 0.33 0.39 -0.23 0.07 0.4
16S 4 46 395 G:C cWW   Strong E 2.9     78.9 17.9                       0.3 938 GC,AU,GU GC,AU 10 4 3 0.43 0.14 0.0 0.14 0.82 1.0 1.23 1.82 0.0 0.89
23S 4.1 46 179 G:C cWW   Strong E     8.6                           91.4 116 UA   0 18 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 -0.25 0.73 0.41 0.04
16S 5 47 361 C:G cWW 3°: base pair Strong E 97.6   1.7 0.1       0.1         0.1   0.1   0.2 936 GC GC,UA,AU 2 2 2 1.0 0.85 1.0 1.85 1.0 1.0 1.83 1.85 0.0 0.89
23S 4.1 47 178 C:G cWW   Strong E   97.4 0.9                           1.8 114 CG CG,UA 1 2 1 0.67 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.84 1.72 0.0 0.43
16S 5 52 359 C:G cWW   Strong E 95.6 3.7 0.1   0.1           0.1     0.2     0.1 940 GC,CG GC,CG,UA 5 6 5 0.91 0.9 1.0 1.9 1.0 1.0 1.74 1.75 0.0 0.89
16S 5 53 358 A:U cWW   Strong E   99.6   0.1   0.1     0.1               0.1 944 CG CG,AU 3 2 2 0.8 0.33 1.0 1.33 1.0 1.0 1.95 1.99 0.0 0.9
16S 5 54 357 C:G cWW   Weak E   99.6       0.2           0.1         0.1 946 CG   1 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.96 1.98 0.0 0.9
23S 5 54 116 G:C cWW   Strong E 24.8       73.5               0.9       0.9 117 GC,GU   0 4 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.99 1.91 1.0 0.0 0.44
23S 5 55 115 G:C cWW   Strong E 21.4 0.9   73.5 3.4                       0.9 117 GC,AU,GU GC,CG,AU 7 4 2 0.36 0.87 0.97 1.83 0.97 1.0 1.04 1.04 0.0 0.44
16S 5 56 356 U:A cWW   Weak E     99.5       0.2           0.1   0.1   0.1 958 UA   1 1 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.95 1.99 0.0 0.91
23S 5 56 114 A:U cWW   Strong E 6.8 8.5 5.1 78.6                         0.9 117 GC,CG,UA,AU GC,CG,UA,AU 3 6 5 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 0.81 0.85 0.0 0.44
16S 5 57 355 G:C cWW   Strong E 99.7                         0.1 0.1   0.1 957 GC   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.97 1.99 0.0 0.91
23S 6 57 70 C:G cWW   Strong E   98.3                             1.6 118 CG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.91 1.78 0.01 0.44
16S 5 58 354 C:G cWW   Weak E   99.6       0.1     0.1         0.1     0.1 960 CG   0 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.95 1.99 0.0 0.91
23S 6 58 69 G:C cWW   Strong E 94.9     0.8 2.5     0.8                 0.8 118 GC,GU GC,AU 2 3 1 0.4 0.2 0.0 0.2 0.97 0.99 1.81 1.56 0.01 0.45
23S 6 59 68 U:G cWW   Strong E   76.3 10.2     12.7                     0.8 118 CG,UA,UG CG,UA 5 3 2 0.5 0.44 0.87 1.32 0.87 1.0 1.22 1.31 0.01 0.45
16S 6 61 106 G:C cWW   Strong E 96.3     0.3 2.6           0.1   0.2 0.1 0.2 0.1 0.1 963 GC,GU GC,AU 1 10 1 0.18 0.09 0.0 0.09 0.97 0.99 1.91 1.77 0.0 0.91
23S 6.1 61 93 C:G cWW 3°: pseudoknot Strong E           0.9                     99.1 117     5 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.38 -0.05 0.45 0.0
16S 6 62 105 U:G cWW   Weak E                                 100.0 965     5 6 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.72 -0.01 0.0 0.0
23S 6.1 62 92   cWW 3°: pseudoknot Strong E                           0.9     99.1 117     7 0 0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.23 -0.05 0.45 0.0

Next page

Advanced export

JSON shape: default, array, newline-delimited

CSV options: 

CREATE VIEW basepair_combined as
select f.molecule, f.helix_number, f.position_1, f.position_2,
       f.reference_base_pair, f.conformation, f.tertiary_type, f.strength, f.group_code,
       f.GC, f.CG, f.UA, f.AU, f.GU, f.UG, f.AA, f.AC, f.AG, f.CA, f.CC, f.CU, f.GA, f.GG, f.UC, f.UU, f.gap, f.Seq as sequences,
       f.predominant_types, f.covarying_types,
       s.Xch, s.Ych, s.PE, s.PES, s.Cov1, s.Cov3, s."C1+C3" as C1_C3,
       s.WC, s.WCGU, s.XCons, s.YCons, s.DfDel, s.PNuc
from basepair_frequency f
left join basepair_collective_score s
  on s.molecule = f.molecule and s.position_1 = f.position_1
 and s.position_2 = f.position_2 and s.group_code = f.group_code;